RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491075.1

CLIP2-208, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene CLIP2, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLIP2-208	ENST00000491075	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CLIP2-208	ENST00000491075	TRIQK	Q629K1	86 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CLIP2-208	ENST00000491075	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CLIP2-208	ENST00000491075	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CLIP2-208	ENST00000491075	RASL10A	Q92737	203 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CLIP2-208	ENST00000491075	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF138	P52744	262 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CLIP2-208	ENST00000491075	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CLIP2-208	ENST00000491075		Q8N814	137 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CLIP2-208	ENST00000491075	SPX	Q9BT56	116 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CLIP2-208	ENST00000491075	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	CCS	O14618	274 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	C1QB	P02746	253 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	S100A11	P31949	105 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	MUC21	Q5SSG8	566 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	FGF7	P21781	194 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	BTC	P35070	178 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	SULT1A1	P50225	295 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	TIRAP	P58753	221 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075		Q8TAT8	98 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	CENPX	A8MT69	81 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	HBG1	P69891	147 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	HBG2	P69892	147 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF266	Q14584	549 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	BAK1	Q16611	211 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	PPT1	P50897	306 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	STX12	Q86Y82	276 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	IGSF23	A1L1A6	192 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	RBAKDN	A6NC62	111 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	ATP6V1F	Q16864	119 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075		Q6AWC8	147 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075		Q9HAA7	133 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CLIP2-208	ENST00000491075	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	C5orf51	A6NDU8	294 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	CSN1S1	P47710	185 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	OR51M1	Q9H341	326 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075		Q6ZSA8	131 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	C2orf50	Q96LR7	162 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075		M0R2P5	195 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	S100A10	P60903	97 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	TDRG1	Q3Y452	100 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	FXYD5	Q96DB9	178 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	OR10J4	P0C629	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	SYT8	Q8NBV8	401 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	LAGE3	Q14657	143 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	NAGK	Q9UJ70	344 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	TM2D2	Q9BX73	214 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	IGHV3-30	P01768	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	IGHV3-33	P01772	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	RAB32	Q13637	225 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	THAP6	Q8TBB0	222 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CLIP2-208	ENST00000491075	OR7C2	O60412	319 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	IL7	P13232	177 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CLIP2-208	ENST00000491075	TMED6	Q8WW62	240 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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