RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 FAM231CP0DMU5 169 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 C12orf74Q32Q52 190 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 FAM210BQ96KR6 192 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 EPDR1Q9UM22 224 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
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GARNL3-217ENST00000481875 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
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GARNL3-217ENST00000481875 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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GARNL3-217ENST00000481875 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.27□□□□□ -1.09
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GARNL3-217ENST00000481875 ATG101Q9BSB4 218 aa8.25□□□□□ -1.09
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GARNL3-217ENST00000481875 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 J3KRW8 73 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 M0R2Z0 102 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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GARNL3-217ENST00000481875 Q8TAT8 98 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 ODF3Q96PU9 254 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 TREM1Q9NP99 234 aa8.21□□□□□ -1.1
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