RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 UQCRFS1P47985 274 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CRYBA4P53673 196 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 Q6ZQT7 251 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 RNF223E7ERA6 249 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 G3V318 75 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 ATP6V0E1O15342 81 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CACNG7P62955 275 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 HSD52Q0P140 79 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 ECSCRQ19T08 205 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CCDC140Q96MF4 163 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 A6NDN8 102 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 BUB3O43684 328 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CLEC3BP05452 202 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 RAXQ9Y2V3 346 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CKS2P33552 79 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 A0A0G2JLM5 398 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 ORM1P02763 201 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 HBDP02042 147 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 DTX2Q86UW9 622 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CNFNQ9BYD5 112 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 DKK2Q9UBU2 259 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 EVI2AP22794 236 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 SAA4P35542 130 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 C18orf15Q96N68 181 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 OOSP1A8MZH6 123 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 PCP2Q8IVA1 136 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 TRGV3P03979 118 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 A0A1W2PPM0 123 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 KIR3DS1Q14943 382 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 KLRB1Q12918 225 aa8.4□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 LINC01559Q495D7 138 aa8.4□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 RAB37Q96AX2 223 aa8.4□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.4□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 TNFRSF6BO95407 300 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 UBE2E1P51965 193 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 KLK9Q2XQG4 91 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM219Q86XT9 240 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 DPF1Q92782 380 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 LINC01546A6NGU7 62 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 FABP2P12104 132 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 LMO4P61968 165 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 MRAP2Q96G30 205 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 IGF1P05019 195 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 LEPP41159 167 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 NMUP48645 174 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 PRR9Q5T870 116 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 J3QR89 54 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 ODF1Q14990 250 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1689.6 ms