RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 C9orf170A2RU37 121 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 ARRDC5A6NEK1 342 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 J3QR89 54 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 TXNDC9O14530 226 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 CST7O76096 145 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 NDUFB2O95178 105 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV1-69P01742 117 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV1-16P04430 117 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00694P0DN24 101 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 CXCL8P10145 99 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM11P57052 281 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 FXYD7P58549 80 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 SPANXN3Q5MJ09 141 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 Q5W150 140 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF175Q8N4F7 328 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 C14orf144Q96I85 54 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 CBLN4Q9NTU7 201 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 U3KQA8 63 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-204ENST00000461653 MED13Q9UHV7 2174 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 DOCK4Q8N1I0 1966 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 NOTCH1P46531 2555 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A087X0T9 212 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 SOD1P00441 154 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF19P17023 458 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE2BP63146 152 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00305Q7Z4B0 112 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 PKMYT1Q99640 499 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 OSTCQ9NRP0 149 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 JMJD1CQ15652 2540 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 ANK1P16157 1881 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 IRGMA1A4Y4 181 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM212A6NML5 194 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 LY6LH3BQJ8 138 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 PANO1I0J062 215 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 K7EM74 188 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 HCRTO43612 131 aa2.95□□□□□ -1.94
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RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV3-7P01780 117 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 SMIM6P0DI80 62 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 P0DMU3 169 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM231AP0DMU4 169 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM231CP0DMU5 169 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 NDUFA6P56556 154 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa2.95□□□□□ -1.94
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RABGGTB-204ENST00000461653 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 COA4Q9NYJ1 87 aa2.95□□□□□ -1.94
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RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 C17orf51A8MQB3 221 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 C10orf142B7Z368 130 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 K7ERJ3 54 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 C1QAP02745 245 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLC6P0CF74 106 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 MPV17P39210 176 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 DYNLT3P51808 116 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 GNG2P59768 71 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 COPZ1P61923 177 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF79Q15937 498 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 MND1Q9BWT6 205 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 FAIMQ9NVQ4 179 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 HS3ST2Q9Y278 367 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 NUMA1Q14980 2115 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 NUP210LQ5VU65 1888 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 DENND4CQ5VZ89 1909 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM92AA1XBS5 289 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 F6UZH7 168 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 TSPAN19P0C672 248 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 WNT4P56705 351 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 HBBP68871 147 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 AKR1C1Q04828 323 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF141Q15928 474 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 TAF9Q16594 264 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 OCIAD2Q56VL3 154 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 SCIMPQ6UWF3 145 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 MIR17HGQ75NE6 70 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 CTAGE3PQ8IX95 158 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-204ENST00000461653 PDZD9Q8IXQ8 264 aa2.93□□□□□ -1.94
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