RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 SPINK4O60575 86 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 MPDU1O75352 247 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 RAB3DO95716 219 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 CD3DP04234 171 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 GPX1P07203 203 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 ANXA3P12429 323 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 CXCL2P19875 107 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 ASIPP42127 132 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 TAS2R19P59542 299 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 SELENOTP62341 195 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 CTF1Q16619 201 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 SCXQ7RTU7 201 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 Q8N976 141 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 NHLRC2Q8NBF2 726 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 OR51S1Q8NGJ8 323 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 IL22RA2Q969J5 263 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 NAA60Q9H7X0 242 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 COX11Q9Y6N1 276 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1-204ENST00000444685 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.4□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.4□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 A0A0B4J2A0 478 aa3.4□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 C7orf71A4D174 169 aa3.4□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 FABP12A6NFH5 140 aa3.4□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 H3BMQ9 156 aa3.4□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 H3BRN7 92 aa3.4□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 SRPXP78539 464 aa3.4□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.4□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.4□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 Q6ZSA8 131 aa3.4□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa3.4□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa3.4□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 ODF3Q96PU9 254 aa3.4□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 IGLV2-8P01709 118 aa3.39□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 LINC00869P0C866 280 aa3.39□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 CT45A10P0DMU9 189 aa3.39□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 LINC00477Q96M19 166 aa3.39□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.38□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 A0A0D9SG52 128 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 GGTLC3B5MD39 225 aa3.38□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 SYNGR2O43760 224 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 IGLV2-11P01706 119 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 IGHV3-30P01768 117 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 IGHV3-33P01772 117 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 NMBP08949 121 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 SEC11BP0C7V7 166 aa3.38□□□□□ -1.87
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