RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 KMT2AQ03164 3969 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 TMEM218A2RU14 115 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 IGLV2-11P01706 119 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 HLA-DRB4P13762 266 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 TAS2R60P59551 318 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 PRNTQ86SH4 94 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 Q86TA4 180 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 LINC00477Q96M19 166 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 PSG8Q9UQ74 426 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 ZNF727A8MUV8 499 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 H3BMM0 161 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 ZNF138P52744 262 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 CENPWQ5EE01 88 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 Q8TAT8 98 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 C9JCJ5 164 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 DEFB4AO15263 64 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 LTAP01374 205 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 CT45A10P0DMU9 189 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 GNG4P50150 75 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 STHQ8IWL8 128 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 CSTL1Q9H114 145 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 ZNF492Q9P255 531 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 A8MTW9 85 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 F8W036 122 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 IGKV3-20P01619 116 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 BAGE2Q86Y30 109 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 OR11H2Q8NH07 326 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 ODF3Q96PU9 254 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 ADCYAP1P18509 176 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 LEPP41159 167 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 TVP23CQ96ET8 276 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 SMIM12Q96EX1 92 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 SEC11CQ9BY50 192 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 NAT8Q9UHE5 227 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-208ENST00000438888 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 TSPOP30536 169 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 AMTNQ6UX39 209 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 C8orf49Q96NF6 230 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 IGLV2-8P01709 118 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 CRISP2P16562 243 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 OCC1Q8TAD7 63 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 MLST8Q9BVC4 326 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 KLLNB2CW77 178 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 M0R2Z0 102 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 MGST1P10620 155 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 CDKN1BP46527 198 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 FXYD7P58549 80 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 SMUG1Q53HV7 270 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 COX8CQ7Z4L0 72 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 LINC01551Q86U37 167 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 BIN3Q9NQY0 253 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 J3KRW8 73 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 GCGP01275 180 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 AMBPP02760 352 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 GPX1P07203 203 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 ADIRFQ15847 76 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 C7orf71A4D174 169 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms