RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		12.28	□□□□□ -0.44
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNA5	P01569	189 aa		12.27	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	KHDC3L	Q587J8	217 aa		12.27	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	C6orf223	Q8N319	242 aa		12.27	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738		Q8TAT8	98 aa		12.27	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		12.27	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		12.27	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738		Q9H8V8	135 aa		12.27	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		12.27	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		12.26	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		12.26	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		12.26	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS13	O14921	159 aa		12.26	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	CSN1S1	P47710	185 aa		12.26	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TAS2R45	P59539	299 aa		12.26	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ESRG	Q1W209	222 aa		12.26	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A096LPF7	62 aa		12.25	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF266	Q14584	549 aa		12.25	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		12.25	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	HERC1	Q15751	4861 aa		12.25	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	DIRC3	C9JPN6	131 aa		12.24	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6AWC8	147 aa		12.24	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		12.24	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		12.24	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		12.24	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	12.23	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TMED6	Q8WW62	240 aa		12.23	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ALG5	Q9Y673	324 aa		12.23	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		12.22	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		12.22	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		12.22	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	OTOR	Q9NRC9	128 aa		12.22	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF415	Q09FC8	603 aa		12.21	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738	TTC32	Q5I0X7	151 aa		12.21	□□□□□ -0.45
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PPQ1	181 aa		12.2	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	PGP	A6NDG6	321 aa		12.2	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	PTTG1	O95997	202 aa		12.2	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB2A	P61019	212 aa		12.2	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		12.2	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PPV4	95 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	MUC21	Q5SSG8	566 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	HYLS1	Q96M11	299 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	CRYBA4	P53673	196 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	SLA	Q13239	276 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	FHL2	Q14192	279 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	TDRG1	Q3Y452	100 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	AQP10	Q96PS8	301 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	PRO0255	Q9UI72	69 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	PAX4	O43316	350 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV3-53	P01767	116 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	RASL10A	Q92737	203 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	TVP23C	Q96ET8	276 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	STAG3L2	P0CL84	134 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	STAG3L3	P0CL85	134 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	SUN5	Q8TC36	379 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	SPX	Q9BT56	116 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	MED28	Q9H204	178 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MRPL28-203	ENST00000429738	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V0C	P27449	155 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	GNG5	P63218	68 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738		Q5BKY6	102 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF479	Q96JC4	524 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	C8orf49	Q96NF6	230 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	SFTA3	P0C7M3	94 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	SERF2	P84101	59 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	ASB13	Q8WXK3	278 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB24	Q969Q5	203 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	TREM1	Q9NP99	234 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		12.12	□□□□□ -0.47

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