RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 BTN1A1Q13410 526 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 CASC10Q5T4H9 136 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 Q6AWC8 147 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 TREM1Q9NP99 234 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 PSG8Q9UQ74 426 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 A0A1B0GV50 99 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 C11orf94C9JXX5 98 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 HTN1P15515 57 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 DKK2Q9UBU2 259 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-210ENST00000423693 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 NUPR2A6NF83 97 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 LYRM9A8MSI8 78 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 RGS13O14921 159 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 IFNA1P01562 189 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 AZU1P20160 251 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 ATP5G3P48201 142 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 EMP1P54849 157 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 CCL20P78556 96 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 PRR9Q5T870 116 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 TVP23CQ96ET8 276 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 FMC1Q96HJ9 113 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 PRNTQ86SH4 94 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 SGK494Q96LW2 274 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 LINC00479Q96M42 142 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 GNG13Q9P2W3 67 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 CBY3A6NI87 242 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 PRM2P04554 102 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 UBE2G1P62253 170 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 C12orf74Q32Q52 190 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 TDRG1Q3Y452 100 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 SMUG1Q53HV7 270 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 CELA1Q9UNI1 258 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 SNURFLB1AK76 121 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 AKR1C3P42330 323 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 Q86TA4 180 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 KCNS1Q96KK3 526 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 PDE6DO43924 150 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 LTAP01374 205 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 BCL2P10415 239 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 DAD1P61803 113 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 TEX261Q6UWH6 196 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 C11orf52Q96A22 123 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 C8orf49Q96NF6 230 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 VAX2Q9UIW0 290 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 GCGP01275 180 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 TCTAP57738 103 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 Q6ZQT7 251 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 Q6ZTC4 211 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-210ENST00000423693 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-210ENST00000423693 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-210ENST00000423693 TCL1AP56279 114 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-210ENST00000423693 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-210ENST00000423693 MUC21Q5SSG8 566 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-210ENST00000423693 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-210ENST00000423693 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-210ENST00000423693 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-210ENST00000423693 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF415Q09FC8 603 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-210ENST00000423693 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-210ENST00000423693 FAM210BQ96KR6 192 aa9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms