RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 TUBA4BQ9H853 241 aa12.46□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 B4DEV8 164 aa12.45□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0R2Z0 102 aa12.45□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM162BQ5T6X4 162 aa12.45□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 ISOC2Q96AB3 205 aa12.45□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 FABP5P3A8MUU1 101 aa12.44□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 A8MZ25 164 aa12.44□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0R036 132 aa12.44□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNAPINO95295 136 aa12.44□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 PFN1P07737 140 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6AWC8 147 aa12.44□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR27Q6MZM9 219 aa12.44□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV21A0A0B4J279 112 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 C7orf71A4D174 169 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 J3KRW8 73 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.43□□□□□ -0.42
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CRIP1P50238 77 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5I1Q13606 314 aa12.43□□□□□ -0.42
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM231DQ6ZW35 169 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 SFRP2Q96HF1 295 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 SH2D1AO60880 128 aa12.43□□□□□ -0.42
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ERVFC1-1P60608 527 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 GFI1BQ5VTD9 330 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR2DL5AQ8N109 375 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLRN3Q8NCR9 226 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 C20orf144Q9BQM9 153 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSTL1Q9H114 145 aa12.43□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa12.42□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 C19orf71A6NCJ1 209 aa12.42□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRXO43186 299 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOC4P55056 127 aa12.42□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 FXYD7P58549 80 aa12.42□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTN1A1Q13410 526 aa12.42□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR3DS1Q14943 382 aa12.42□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 RHEBQ15382 184 aa12.42□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 C15orf54Q8N8G6 183 aa12.42□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 OSTCQ9NRP0 149 aa12.42□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 INSP01308 110 aa12.41□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 P01737 135 aa12.41□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT-ND4LP03901 98 aa12.41□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDT10Q8NFP7 164 aa12.41□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDT11Q96G61 164 aa12.41□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa12.4□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R2P9O14990 202 aa12.4□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 CA1P00915 261 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANAPC16Q96DE5 110 aa12.4□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 XCL2Q9UBD3 114 aa12.4□□□□□ -0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM256Q8N2U0 113 aa12.39□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10G8Q8NGN5 311 aa12.39□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A087WWC5 75 aa12.38□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 C7orf77A4D0Y5 90 aa12.38□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2CO00762 179 aa12.38□□□□□ -0.43
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF212Q495C1 297 aa12.38□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01559Q495D7 138 aa12.38□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTDSP1Q9GZU7 261 aa12.38□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 H7BYZ3 331 aa12.37□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ORM1P02763 201 aa12.37□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 CT83Q5H943 113 aa12.37□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM159AQ6UWV7 190 aa12.37□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNS1Q96KK3 526 aa12.37□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS10P5Q9NQ39 176 aa12.37□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 XKRY2A2RUG3 117 aa12.36□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM189A5PLL7 270 aa12.36□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TDRG1Q3Y452 100 aa12.36□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.36□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2D3Q8NGH3 330 aa12.36□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PYGO2Q9BRQ0 406 aa12.36□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00467Q9BRT7 94 aa12.36□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM242Q9NWH2 141 aa12.36□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.36□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.36□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 V9GYV3 84 aa12.36□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOTCH3Q9UM47 2321 aa12.36□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBMY1CP0DJD4 496 aa12.35□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS20P60866 119 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZQT7 251 aa12.35□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM208Q9BTX3 173 aa12.35□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa12.35□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa12.34□□□□□ -0.43
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