RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 TUBA4BQ9H853 241 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 H7BYZ3 331 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 CRISP2P16562 243 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 FXYD7P58549 80 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 RNF212Q495C1 297 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 DEFB125Q8N687 156 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 OSTCQ9NRP0 149 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 XKRY2A2RUG3 117 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 C7orf71A4D174 169 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 A8MTW9 85 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 G3V4G9 280 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 M0R2Z0 102 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 SH2D1AO60880 128 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 FAM19A4Q96LR4 140 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 WNK1Q9H4A3 2382 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 A0A087WWC5 75 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM189A5PLL7 270 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 KLLNB2CW77 178 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 ORM1P02763 201 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 S100PP25815 95 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 BTN1A1Q13410 526 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 AMTNQ6UX39 209 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 NUDT11Q96G61 164 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 NAGKQ9UJ70 344 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 A8MWL6 223 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 INSP01308 110 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 CRIP1P50238 77 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 APOC4P55056 127 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 PRR9Q5T870 116 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 Q6AWC8 147 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRK-201ENST00000368202 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP10-11P60412 298 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 Q8N1Y9 231 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 KCNS1Q96KK3 526 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 IL36BQ9NZH7 164 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 XCL2Q9UBD3 114 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 V9GYV3 84 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 KIR3DS1Q14943 382 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01559Q495D7 138 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 CT83Q5H943 113 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 MUC21Q5SSG8 566 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 BORCS7Q96B45 105 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 CSTL1Q9H114 145 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 CXorf65A6NEN9 183 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 SCO1O75880 301 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 TSKUQ8WUA8 353 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 IMMP2LQ96T52 175 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01587Q99440 93 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-201ENST00000368202 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms