RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 PRR9Q5T870 116 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2BHQ93079 126 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2BNQ99877 126 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 NDFIP1Q9BT67 221 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 KIR3DS1Q14943 382 aa11.49□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.49□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 CT83Q5H943 113 aa11.49□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.49□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.49□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00477Q96M19 166 aa11.49□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.49□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa11.49□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM189A5PLL7 270 aa11.48□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.48□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf21Q9P2W6 132 aa11.48□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 TENM1Q9UKZ4 2725 aa11.48□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.47□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 SNURFLB1AK76 121 aa11.46□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 ORM1P02763 201 aa11.46□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFA6P56556 154 aa11.46□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 RAB4BP61018 213 aa11.46□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 PAFAH1B2P68402 229 aa11.46□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.46□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 GFRA4Q9GZZ7 299 aa11.46□□□□□ -0.57
CASQ1-201ENST00000368078 GRIFINA4D1Z8 144 aa11.46□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV3-20P01619 116 aa11.46□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 CAMPP49913 170 aa11.46□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 SSTP61278 116 aa11.46□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF124Q15973 351 aa11.46□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.46□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.46□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.45□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.45□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 MUC21Q5SSG8 566 aa11.45□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.45□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 TPPP3Q9BW30 176 aa11.45□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.44□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0J9YX75 114 aa11.44□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 S100A6P06703 90 aa11.44□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA1644Q3SXP7 199 aa11.44□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 GNB1LQ9BYB4 327 aa11.44□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 FAM231BA6NCW3 169 aa11.44□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 C5orf52A6NGY3 159 aa11.44□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 GPX1P07203 203 aa11.44□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 DEFB131AP59861 70 aa11.44□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 LENEPQ9Y5L5 61 aa11.44□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GXF2 115 aa11.43□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 ARMS2P0C7Q2 107 aa11.43□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.43□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.43□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 ATRQ13535 2644 aa11.42□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 KNCNA6PVL3 124 aa11.42□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 LINC01559Q495D7 138 aa11.42□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.42□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 VWFP04275 2813 aa11.41□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 SAP30O75446 220 aa11.41□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 SLAQ13239 276 aa11.41□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.41□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 WDR73Q6P4I2 378 aa11.41□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GUS0 222 aa11.4□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 CRISP2P16562 243 aa11.4□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.4□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa11.4□□□□□ -0.58
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.4□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GUT8 65 aa11.4□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 XKRY2A2RUG3 117 aa11.4□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 M0R2Z0 102 aa11.4□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 HBBP68871 147 aa11.4□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa11.4□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.4□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.4□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 NAGKQ9UJ70 344 aa11.4□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 KLLNB2CW77 178 aa11.39□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 IGLC6P0CF74 106 aa11.39□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 FXYD7P58549 80 aa11.39□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 RPS20P60866 119 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 RASL11AQ6T310 242 aa11.39□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.39□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.39□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.39□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.38□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 APCSP02743 223 aa11.38□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 COX19Q49B96 90 aa11.38□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.38□□□□□ -0.59
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV21A0A0B4J279 112 aa11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms