RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 C21orf62Q9NYP8 219 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 HIGD1AQ9Y241 93 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 C5orf49A4QMS7 147 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 C17orf98A8MV24 154 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 H0YGG7 62 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 LY6LH3BQJ8 138 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 K7EM74 188 aa2.57□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 SPINK4O60575 86 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 OR2H2O95918 312 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 GP1BBP13224 206 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 CD52P31358 61 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 DLX6P56179 175 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 EDDM3BP56851 147 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 HES1Q14469 280 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 MIC13Q5XKP0 118 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZQT7 251 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 ITLN1Q8WWA0 313 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 C2orf48Q96LS8 159 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 TRGV9Q99603 122 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 OVOL2Q9BRP0 275 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 KLRF1Q9NZS2 232 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 A8MWV9 139 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 M0R135 149 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 EFNA2O43921 213 aa2.56□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 MGST1P10620 155 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 COL8A2P25067 703 aa2.56□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 HERVK_113P63121 156 aa2.56□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 FAM27BQ5VT28 67 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 REG3GQ6UW15 175 aa2.56□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 SLC37A2Q8TED4 501 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 IFI27L1Q96BM0 104 aa2.56□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa2.56□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 TRAV24A0A0B4J272 114 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.55□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
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