RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.74□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ITPR2Q14571 2701 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 I3L2K1 104 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PAGE4O60829 102 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ECSCRQ19T08 205 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ZMAT4Q9H898 229 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ZANQ9Y493 2812 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3-48P01763 117 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MALP21145 153 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 YPEL4Q96NS1 127 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ST20Q9HBF5 79 aa4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 IGHG2P01859 326 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 RND2P52198 227 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 THAP8Q8NA92 274 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 NPIPB3Q92617 1050 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 C20orf78Q9BR46 151 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PXMP4Q9Y6I8 212 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PLXNB1O43157 2135 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TRAV41A0A0B4J266 112 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 G3V318 75 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 K7EIM0 57 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 BLCAPP62952 87 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MIC13Q5XKP0 118 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 Q71RC1 249 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 STPG3Q8N7X2 389 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TEX15Q9BXT5 2789 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 A0A087WWC5 75 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 APOMO95445 188 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 IGF1P05019 195 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 IGLC6P0CF74 106 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 PSMB3P49720 205 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 KLK9Q2XQG4 91 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 Q56UQ5 140 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZS46 218 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZWC4 215 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 C18orf15Q96N68 181 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SMR3AQ99954 134 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MANBALQ9NQG1 85 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 RPRMQ9NS64 109 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 KLK9Q9UKQ9 250 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.72□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.71□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 CXorf1O96002 111 aa4.71□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 ZNF726P1Q15940 193 aa4.71□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.71□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa4.71□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZUT4 128 aa4.71□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 H3BS24 57 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 LY6G6DO95868 133 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 LINC00869P0C866 280 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 GALR1P47211 349 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PRR20EP86478 221 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PRR20CP86479 221 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PRR20DP86480 221 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PRR20BP86481 221 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PRR20AP86496 221 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 SLC39A9Q9NUM3 307 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 LINC00527Q9UJ94 153 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ZFP92A6NM28 416 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 BMPR1BO00238 502 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ZNF253O75346 499 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 P01737 135 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ZNF90Q03938 601 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TMEM86BQ8N661 226 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TRGV9Q99603 122 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 FBXL7Q9UJT9 491 aa4.71□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CRISP2P16562 243 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 SRIP30626 198 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 ZNF580Q9UK33 172 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 S4R3C0 116 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 CSN3P07498 182 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 TXNDC17Q9BRA2 123 aa4.7□□□□□ -1.66
CCR6-201ENST00000341935 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.7□□□□□ -1.66
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