RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339365.2

SEC24C-201, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEC24C, Length 4,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-201ENST00000339365 CFHR3Q02985 330 aa8.34□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 RNF152Q8N8N0 203 aa8.34□□□□□ -1.07
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SEC24C-201ENST00000339365 LEPROTL1O95214 131 aa8.33□□□□□ -1.08
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SEC24C-201ENST00000339365 IGLL1P15814 213 aa8.33□□□□□ -1.08
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SEC24C-201ENST00000339365 IQCJQ1A5X6 159 aa8.33□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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SEC24C-201ENST00000339365 FXYD5Q96DB9 178 aa8.32□□□□□ -1.08
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SEC24C-201ENST00000339365 LINC01549A6NIU2 74 aa8.32□□□□□ -1.08
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SEC24C-201ENST00000339365 LINC01551Q86U37 167 aa8.31□□□□□ -1.08
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SEC24C-201ENST00000339365 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 A0A087WWL8 130 aa8.3□□□□□ -1.08
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SEC24C-201ENST00000339365 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.29□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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SEC24C-201ENST00000339365 EREGO14944 169 aa8.29□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.29□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
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SEC24C-201ENST00000339365 C16orf74Q96GX8 76 aa8.29□□□□□ -1.08
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SEC24C-201ENST00000339365 ZNF492Q9P255 531 aa8.29□□□□□ -1.08
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SEC24C-201ENST00000339365 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.29□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 DEFB125Q8N687 156 aa8.29□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 GAGE12JA6NER3 117 aa8.28□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 GAGE1Q13065 139 aa8.28□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 GAGE4Q13068 117 aa8.28□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 GAGE5Q13069 117 aa8.28□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 GAGE13Q4V321 117 aa8.28□□□□□ -1.08
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SEC24C-201ENST00000339365 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 M0R2P5 195 aa8.28□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 PAX2Q02962 417 aa8.28□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.28□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.28□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 C8orf49Q96NF6 230 aa8.28□□□□□ -1.08
SEC24C-201ENST00000339365 SPATA25Q9BR10 227 aa8.28□□□□□ -1.08
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