RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR73Q6P4I2 378 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP82Q8N141 532 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 DCANP1Q8TF63 244 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf49Q96NF6 230 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PRX2 142 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM189A5PLL7 270 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 HIGD1CA8MV81 97 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 CRIP1P50238 77 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 PROK1P58294 105 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 RASL11AQ6T310 242 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 RAX2Q96IS3 184 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 NEU1Q99519 415 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 MT-ND6P03923 174 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 CSN3P07498 182 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 EDN2P20800 178 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 TFPI2P48307 235 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 NUP35Q8NFH5 326 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8TAT8 98 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 DUX3Q96PT4 197 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 K7EQG2 157 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 SPINK4O60575 86 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 SH2D1AO60880 128 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 ORM1P02763 201 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 FHL3Q13643 280 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6AWC8 147 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 FRZBQ92765 325 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 BORCS7Q96B45 105 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 GPX1P07203 203 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB4BP61018 213 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMG4Q5JS54 123 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GW15 77 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 SNURFLB1AK76 121 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2BKO60814 126 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-DQA1P01909 254 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 S100A8P05109 93 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2BJP06899 126 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF688P0C7X2 276 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 TRGC1P0CF51 173 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2BOP23527 126 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2BBP33778 126 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2BDP58876 126 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2BCP62807 126 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GUT8 65 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4C46A6NHA9 309 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPOP30536 169 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFA6P56556 154 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 RIGQ13278 110 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 GTSF1Q8WW33 167 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf52A6NGY3 159 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 F2Z2F3 143 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 F6UB75 175 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 PHOX2AO14813 284 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 GZMBP10144 247 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 HBBP68871 147 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.3 ms