RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.1□□□□□ -1.27
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PTPRB-201ENST00000261266 ZMAT4Q9H898 229 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRB-201ENST00000261266 GAGE5Q13069 117 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRB-201ENST00000261266 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 ODF3BA8MYP8 253 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 BUB3O43684 328 aa7.04□□□□□ -1.28
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