RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 K7EQD1 137 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 LHBP01229 141 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 DEFB113Q30KQ7 82 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 ARTNQ5T4W7 220 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 RNF138Q8WVD3 245 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 WDR81Q562E7 1941 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 NPYP01303 97 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 PTPRDP23468 1912 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 LY6HO94772 140 aa5.69□□□□□ -1.5
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CPS1-201ENST00000233072 IGLC3P0DOY3 106 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 CFHR3Q02985 330 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 CYYR1Q96J86 154 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 MYOFQ9NZM1 2061 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 FGF6P10767 208 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 ZNRD1Q9P1U0 126 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 HELZP42694 1942 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 NINQ8N4C6 2090 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 PFN2P35080 140 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 CARD19Q96LW7 228 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 CCL24O00175 119 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 NDUFS7O75251 213 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 Q6ZWC4 215 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.68□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 CXCL5P42830 114 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 HAMPP81172 84 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 PRSS33Q8NF86 280 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 CFHR4Q92496 578 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 CKAP5Q14008 2032 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 K7EMT4 169 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 ATP5G1P05496 136 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 NPSP0C0P6 89 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 CGB3P0DN86 165 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 MYLKQ15746 1914 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 DEFB112Q30KQ8 113 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.67□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 IGHG2P01859 326 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 H0YGX0 51 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 U3KQE9 123 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 I3L2K1 104 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 C9JQL5 133 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 C11orf53Q8IXP5 236 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 MYCNOSP40205 109 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 PRR31Q5SQ13 230 aa5.66□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 B5MCH6 92 aa5.65□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 F6UB75 175 aa5.65□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 GP9P14770 177 aa5.65□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 ETDBQ3ZM63 59 aa5.65□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.65□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 K7EN84 100 aa5.65□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CPS1-201ENST00000233072 SPART-AS1P0CW21 52 aa5.65□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 C5orf47Q569G3 176 aa5.65□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.65□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.65□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 CTSZQ9UBR2 303 aa5.65□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 A0A0B4J2C4 111 aa5.65□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 CFC1BP0CG36 223 aa5.65□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 CFC1P0CG37 223 aa5.65□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 CRYBA4P53673 196 aa5.65□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 UBE2BP63146 152 aa5.64□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 C12orf74Q32Q52 190 aa5.64□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.64□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 MYO9BQ13459 2157 aa5.64□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.64□□□□□ -1.51
CPS1-201ENST00000233072 IGLL1P15814 213 aa5.64□□□□□ -1.51
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