RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636769.1

SCN2A-213, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, human

TSL 5

Gene SCN2A, Length 8,573 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCN2A-213	ENST00000636769	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	CFHR1	Q03591	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	PSMB8	P28062	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	PF4	P02776	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	IGLV3-1	P01715	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	GATA4	P43694	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	EFNA4	P52798	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	MLANA	Q16655	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	NBL1	P41271	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	METRN	Q9UJH8	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	PDE6G	P18545	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	FREM3	P0C091	2139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C22orf46	C9J442	243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769		E9PLD3	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769		V9GYY9	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	TFF1	P04155	84 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769		Q8TCH9	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	THBD	P07204	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	CD24	P25063	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	SPTA1	P02549	2419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769		A4D1N5	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	CD59	P13987	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	FAM168A	Q92567	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	MP68	P56378	58 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	CCL19	Q99731	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	COX6B1	P14854	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	CFHR4	Q92496	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	CRYGB	P07316	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	NDUFA4	O00483	81 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769		Q6ZS92	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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