RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4E1P0C645 316 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 VGLL1Q99990 258 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 GGACTQ9BVM4 153 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 KLLNB2CW77 178 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 E5RGE8 158 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 GPX1P07203 203 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 SRIP30626 198 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMLGP49069 296 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 C4orf46Q504U0 113 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
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CAPNS1-217ENST00000629983 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 PSCAO43653 123 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R30P59541 319 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB31Q13636 194 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1L4Q8NGR5 311 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00477Q96M19 166 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 TMBIM6P55061 237 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 FHL2Q14192 279 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 MIC13Q5XKP0 118 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 DEDD2Q8WXF8 326 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM70Q9BUB7 260 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 K7EP13 123 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF253O75346 499 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 NRARPQ7Z6K4 114 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 BCL7BQ9BQE9 202 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMM9Q9Y5J7 89 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYGDP07320 174 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 PFDN5Q99471 154 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV19A0A075B6N1 114 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 L7N2F9 121 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 VAMP2P63027 116 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF415Q09FC8 603 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM19A4Q96LR4 140 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 FLVCR2Q9UPI3 526 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 PRELID1Q9Y255 219 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 V9GYH0 126 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 K7EQD1 137 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf126Q8N4M7 172 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 C7orf66A4D0T2 115 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 SFTA3P0C7M3 94 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 GYPEP15421 78 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 CRISP2P16562 243 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 BCAP31P51572 246 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM78Q5T7P6 136 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 BLNKQ8WV28 456 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 INPP1P49441 399 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR9Q5T870 116 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BMQ9 156 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 MBPP02686 304 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZQT7 251 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 SRRQ9GZT4 340 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 AAMDCQ9H7C9 122 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFB6O95139 128 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNDC17Q9BRA2 123 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 UQCC1Q9NVA1 299 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFB4O95168 129 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ORM1P02763 201 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 PYYP10082 97 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 CAV2P51636 162 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM122CQ6P4D5 195 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF479Q96JC4 524 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A9Q9NUM3 307 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 CST7O76096 145 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 NMBP08949 121 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A5P33763 92 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 BAXQ07812 192 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 C20orf85Q9H1P6 137 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM14CQ9P0S9 112 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE6HQ13956 83 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC21Q5SSG8 566 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR83OSQ9Y284 106 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF846Q147U1 533 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 LRCOL1A6NCL2 159 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 NAP1L6A6NFF2 107 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 C9JCJ5 164 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL29P47914 159 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N814 137 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 Q9HAA7 133 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM30AQ9NZY2 134 aa18.36■□□□□ 0.53
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