RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623297.1

CU639417.6-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU639417.6, Length 3,013 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU639417.6-201ENST00000623297 EVI2AP22794 236 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 PPIFP30405 207 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 SAMD5Q5TGI4 173 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 PRORYQ9H606 182 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 NDUFS7O75251 213 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 HBDP02042 147 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 PSG3Q16557 428 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 TMEM155Q4W5P6 130 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 FAM104BQ5XKR9 115 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.69□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 TMEM189A5PLL7 270 aa11.68□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 FABP2P12104 132 aa11.68□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 LGALS7P47929 136 aa11.68□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 LGALS9BQ3B8N2 356 aa11.68□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.68□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.68□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 NPIPB5A8MRT5 1133 aa11.68□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 VKORC1Q9BQB6 163 aa11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 TEX22C9J3V5 150 aa11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 K7EQM0 130 aa11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 SH2D1AO60880 128 aa11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 PRSS1P07477 247 aa11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 HLA-DMBP28068 263 aa11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 C3orf36Q3SXR2 165 aa11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 NUP37Q8NFH4 326 aa11.67□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 SMIM13P0DJ93 91 aa11.66□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.66□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.66□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.65□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 SORL1Q92673 2214 aa11.65□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CU639417.6-201ENST00000623297 I3L2K1 104 aa11.65□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 J3KRW8 73 aa11.65□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 CCL21O00585 134 aa11.65□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 AZU1P20160 251 aa11.65□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 TMEM30BQ3MIR4 351 aa11.65□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 OR4X2Q8NGF9 303 aa11.65□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 ACACBO00763 2458 aa11.64□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 SHISA9B4DS77 424 aa11.64□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 LEPP41159 167 aa11.64□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 WFDC2Q14508 124 aa11.64□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 AMTNQ6UX39 209 aa11.64□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.64□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.64□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 ZNF491Q8N8L2 437 aa11.64□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 RNF125Q96EQ8 232 aa11.64□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.64□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa11.64□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa11.63□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 FCER1GP30273 86 aa11.63□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 DLX6P56179 175 aa11.63□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 VPS13CQ709C8 3753 aa11.63□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 ORM1P02763 201 aa11.63□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 CD3EP07766 207 aa11.63□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.63□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 FOXC2Q99958 501 aa11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 TMEM160Q9NX00 188 aa11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 K7EIM0 57 aa11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 Q5PR19 223 aa11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 VGLL1Q99990 258 aa11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 H3BRN7 92 aa11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 PAX8Q06710 450 aa11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.62□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 H3BMG7 143 aa11.61□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa11.61□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 DPF1Q92782 380 aa11.61□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 CRYGBP07316 175 aa11.61□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.61□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 LINC00311Q8N616 119 aa11.61□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.6□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 A0A1B0GW15 77 aa11.6□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 SPRY2O43597 315 aa11.6□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 IGLV1-47P01700 117 aa11.6□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 ETDBQ3ZM63 59 aa11.6□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 ARPC1AQ92747 370 aa11.6□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.6□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 U3KQK5 164 aa11.6□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 TMEM8BA6NDV4 472 aa11.6□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 CIDEAO60543 219 aa11.6□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 WFDC12Q8WWY7 111 aa11.6□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 TRAV40A0A0B4J280 105 aa11.6□□□□□ -0.55
CU639417.6-201ENST00000623297 ODF1Q14990 250 aa11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms