RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 PRSS46E5RG02 174 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF134P52741 427 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 FANCMQ8IYD8 2048 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM213A2RRL7 107 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 HIST3H2BBQ8N257 126 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 OVOL2Q9BRP0 275 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 VWC2Q2TAL6 325 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFAF3Q9BU61 184 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM243Q9BU79 118 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 FRMPD3Q5JV73 1810 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 CCL24O00175 119 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 UBE2CO00762 179 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM14CQ9P0S9 112 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 COLCA2A8K830 154 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 ANAPC10Q9UM13 185 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 PKDREJQ9NTG1 2253 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 GAGE6Q13070 117 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 NKAPP1Q8N9T2 125 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 DOCK7Q96N67 2140 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 hDV102S1A0JD36 115 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM141Q96I45 108 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 CTSZQ9UBR2 303 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-208ENST00000613122 THAP8Q8NA92 274 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 FAM231BA6NCW3 169 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 PRR25Q96S07 402 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM256Q8N2U0 113 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 C8orf31Q8N9H6 132 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 KLF12Q9Y4X4 402 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 ATP6V0BQ99437 205 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 IGKV1-39P01597 117 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 IGKV1D-39P04432 117 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 CGB7P0DN87 165 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 ESDP10768 282 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 MEGF9Q9H1U4 602 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF407Q9C0G0 2248 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 C9orf66Q5T8R8 295 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 PMVKQ15126 192 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 CT83Q5H943 113 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 C3orf79P0CE67 100 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 SLAQ13239 276 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 SDHAF1A6NFY7 115 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 IGLC1P0CG04 106 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 C2orf66Q6UXQ4 117 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 FOXI2Q6ZQN5 318 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 CHAC1Q9BUX1 264 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 A0A096LPF7 62 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 FAM104BQ5XKR9 115 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 LURAP1LQ8IV03 231 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 PTPRDP23468 1912 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 Q8N8P6 123 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 DNAJC30Q96LL9 226 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 VWC2LB2RUY7 222 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 OR11H6Q8NGC7 330 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1B0GUS0 222 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 ADORA2A-AS1P86434 159 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 CADP27708 2225 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 FOXE3Q13461 319 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 DEFB136Q30KP8 78 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 PFN2P35080 140 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF114Q8NC26 417 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 PLXNA2O75051 1894 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 NBASA2RRP1 2371 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDP1-208ENST00000613122 C2orf82Q6UX34 121 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 HLA-DRB4P13762 266 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 ANGP03950 147 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 C10orf105Q8TEF2 133 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 IGLV3-1P01715 115 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 NEGR1Q7Z3B1 354 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM126AQ9H061 195 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 VOPP1Q96AW1 172 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 POU2AF1Q16633 256 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 SNHG12Q9BXW3 62 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 C11orf53Q8IXP5 236 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 CYYR1Q96J86 154 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.5 ms