RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.87□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 ODF3Q96PU9 254 aa5.87□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 H3BQ15 152 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 PRAF2O60831 178 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 HOXB5P09067 269 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 TCL1AP56279 114 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 SELENOTP62341 195 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 IL18Q14116 193 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 ZNF680Q8NEM1 530 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 PRO0255Q9UI72 69 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.86□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 C7orf71A4D174 169 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 K7EPK0 472 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 IGLC2P0DOY2 106 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 CD300CQ08708 224 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 ERCC8Q13216 396 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 BTN1A1Q13410 526 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 OPCMLQ14982 345 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 Q6ZQT7 251 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 DIRAS2Q96HU8 199 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 PSENENQ9NZ42 101 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.85□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 KLLNB2CW77 178 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 E5RGE8 158 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 K7EQD1 137 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 SFT2D2O95562 160 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 EVI2AP22794 236 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 PPP1R1AQ13522 171 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 SPCS2Q15005 226 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 S100A7AQ86SG5 101 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 Q8N814 137 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 VGLL1Q99990 258 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.84□□□□□ -1.47
TTR-204ENST00000610404 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 K7EP13 123 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 M0R3E3 92 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 AGPAT2O15120 278 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 SSSCA1O60232 199 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 COX7A2P2O60397 106 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 CRYGDP07320 174 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 SFTA3P0C7M3 94 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 SRIP30626 198 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 C4orf46Q504U0 113 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 PRR9Q5T870 116 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 Q6ZSA8 131 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 ZNF546Q86UE3 836 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 RNF24Q9Y225 148 aa5.83□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 FNDC10F2Z333 226 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 GOSR2O14653 212 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 PSCAO43653 123 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 MPDU1O75352 247 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 OR4E1P0C645 316 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 SMIM18P0DKX4 95 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 ARL16Q0P5N6 197 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 SLAQ13239 276 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 ZNF479Q96JC4 524 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 SMIM8Q96KF7 97 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 MGST2Q99735 147 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 SOSTQ9BQB4 213 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.82□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.81□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 C1QBP02746 253 aa5.81□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 CRISP2P16562 243 aa5.81□□□□□ -1.48
TTR-204ENST00000610404 ZNF415Q09FC8 603 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms