RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605910.1

TRAM2-AS1-202, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 1,053 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF738Q8NE65 137 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RNF183Q96D59 192 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 UMAD1C9J7I0 102 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PAGE4O60829 102 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SEC11BP0C7V7 166 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PYYP10082 97 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C20orf173Q96LM9 149 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 A8MTW9 85 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CXorf1O96002 111 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 STAG3L2P0CL84 134 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 STAG3L3P0CL85 134 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CSN1S1P47710 185 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RAB2AP61019 212 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZFP69Q49AA0 526 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 BAP18Q8IXM2 172 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RNF182Q8N6D2 247 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 BLNKQ8WV28 456 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FXYD5Q96DB9 178 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 USP17L23D6RBM5 183 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC17A3O00476 420 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NDUFB4O95168 129 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OR10J4P0C629 311 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DEFB135Q30KP9 77 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IL17DQ8TAD2 202 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 STOML3Q8TAV4 291 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LINC00477Q96M19 166 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RARRES2Q99969 163 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RFNGQ9Y644 331 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 F6UB75 175 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 H3BTX0 84 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IGKV3-20P01619 116 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HLA-DMBP28068 263 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TSPOP30536 169 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CAMPP49913 170 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RAB5CP51148 216 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RANP62826 216 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ICAM4Q14773 271 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CST9LP1Q5W188 147 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC51BQ86UW2 128 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SUN5Q8TC36 379 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF503Q96F45 646 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ODF3Q96PU9 254 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RBAKDNA6NC62 111 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MIFP14174 115 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CDKN1BP46527 198 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OR11H2Q8NH07 326 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 Q9H3A6 140 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OTORQ9NRC9 128 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 XCL2Q9UBD3 114 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 A0A1B0GVG6 124 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 A0A1W2PRE2 83 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PGPA6NDG6 321 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C3orf84H3BNL1 204 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TEX46H3BTG2 121 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms