RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 SELENOTP62341 195 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H2BCP62807 126 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 TEPPQ6URK8 271 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 GPR82Q96P67 336 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 NEU1Q99519 415 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 AGRNO00468 2067 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF727A8MUV8 499 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 FNDC10F2Z333 226 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 CST7O76096 145 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-DRB4P13762 266 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 FHITP49789 147 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 CCL20P78556 96 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 BAXQ07812 192 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 RAB31Q13636 194 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 ICAM4Q14773 271 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 RPRMQ9NS64 109 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GV90 55 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 F6UB75 175 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 H3BRN7 92 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 SOCS3O14543 225 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 GCGP01275 180 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 TRGC1P0CF51 173 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 FGF7P21781 194 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V0CP27449 155 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 PSG9Q00887 426 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 NHLH2Q02577 135 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 ARL16Q0P5N6 197 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 Q8NAQ8 132 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 FAM210BQ96KR6 192 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 UHRF2Q96PU4 802 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 VAX2Q9UIW0 290 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 RNF24Q9Y225 148 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 COX7A2P2O60397 106 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 TRGC2P03986 189 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 EMP1P54849 157 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 PLP1P60201 277 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 FAM78BQ5VT40 261 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 FRZBQ92765 325 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 C20orf173Q96LM9 149 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 X6R8D5 127 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0J9YX75 114 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 IGSF23A1L1A6 192 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 IGLL5B9A064 214 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 RAB4AP20338 218 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-DMBP28068 263 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 RHOBP62745 196 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 HBG1P69891 147 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 HBG2P69892 147 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 PATE2Q6UY27 113 aa6.02□□□□□ -1.45
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