RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572656.2

TRAPPC1-205, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC1, Length 409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-205ENST00000572656 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC1-205ENST00000572656 L7N2F9 121 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 M0R3E3 92 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 MPDU1O75352 247 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 IGHV3-53P01767 116 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 INPP1P49441 399 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 VAMP2P63027 116 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 BTN1A1Q13410 526 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 MITD1Q8WV92 249 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 PRELID1Q9Y255 219 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 K7EP13 123 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 NDUFB4O95168 129 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 GPX1P07203 203 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 NMBP08949 121 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 CRISP2P16562 243 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 CRYBA4P53673 196 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 PDE6HQ13956 83 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 FHL2Q14192 279 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 ICAM4Q14773 271 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 BAK1Q16611 211 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 C8orf49Q96NF6 230 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 VGLL1Q99990 258 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 SRRQ9GZT4 340 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 RGS13O14921 159 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 PRAF2O60831 178 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 CST7O76096 145 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 GCSHP23434 173 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 BCAP31P51572 246 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 CAV2P51636 162 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 VWC2Q2TAL6 325 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRIQKQ629K1 86 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAT1Q14517 4588 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 CENPXA8MT69 81 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 EVI2AP22794 236 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 S100A11P31949 105 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 BTCP35070 178 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF846Q147U1 533 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 PRR9Q5T870 116 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 E5RGE8 158 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM229AH3BQW9 127 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 K7EQD1 137 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 CCSO14618 274 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 PYYP10082 97 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 SRIP30626 198 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 SULT1A1P50225 295 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 BAXQ07812 192 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF415Q09FC8 603 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 Q6ZQT7 251 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 BLNKQ8WV28 456 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 MDFICQ9P1T7 246 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF492Q9P255 531 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 MYCBP2O75592 4640 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 CCDC160A6NGH7 325 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM25EA8MYX2 175 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 ORM1P02763 201 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF138P52744 262 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC1-205ENST00000572656 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms