RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562291.2

INO80E-204, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-204ENST00000562291 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 RNF222A6NCQ9 220 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 H7BYZ3 331 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 J3KRW8 73 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 CT45A10P0DMU9 189 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 LEPP41159 167 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 KIR3DS1Q14943 382 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 RNF212Q495C1 297 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 SVBPQ8N300 66 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 STOML3Q8TAV4 291 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 THAP6Q8TBB0 222 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 BLNKQ8WV28 456 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 C16orf74Q96GX8 76 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.84□□□□□ -1.31
INO80E-204ENST00000562291 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 H0YIZ8 118 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 ZNF253O75346 499 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 ATP5G1P05496 136 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 PET100P0DJ07 73 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 PYYP10082 97 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 ATP5G3P48201 142 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 ERCC8Q13216 396 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 CLINT1Q14677 625 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 LINC00477Q96M19 166 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 TAAR5O14804 337 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 NDUFB4O95168 129 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 NUDT3O95989 172 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 H2BFSP57053 126 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 BTN1A1Q13410 526 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 ATG101Q9BSB4 218 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 OR51M1Q9H341 326 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 SNURFLB1AK76 121 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 M0R3E3 92 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 SNAPINO95295 136 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 IFNA5P01569 189 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 OR5I1Q13606 314 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 PDE6HQ13956 83 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 ICAM4Q14773 271 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 RNF141Q8WVD5 230 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 ODF3Q96PU9 254 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 PAXXQ9BUH6 204 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 GAGE12BA1L429 117 aa6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 SCO1O75880 301 aa6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 GAGE7O76087 117 aa6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 GPX1P07203 203 aa6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 GAGE12FP0CL80 117 aa6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 GAGE12GP0CL81 117 aa6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 GAGE12IP0CL82 117 aa6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 ATP5SQ99766 215 aa6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 FUT9Q9Y231 359 aa6.8□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 TMEM218A2RU14 115 aa6.79□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 C7orf71A4D174 169 aa6.79□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.79□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 APOC3P02656 99 aa6.79□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 OR10J4P0C629 311 aa6.79□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
INO80E-204ENST00000562291 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms