RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559259.1

MFGE8-210, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-210ENST00000559259 DERL1Q9BUN8 251 aa13.51□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 MAP6D1Q9H9H5 199 aa13.51□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 NAT8Q9UHE5 227 aa13.51□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 RPH3ALQ9UNE2 315 aa13.51□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 PRAC2D3DTV9 90 aa13.5□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 G3V4G9 280 aa13.5□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 S100A1P23297 94 aa13.5□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 CEBPGP53567 150 aa13.5□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.5□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 EBLN2Q6P2I7 272 aa13.5□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 Q86TA4 180 aa13.5□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 ODF3Q96PU9 254 aa13.5□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 PSG8Q9UQ74 426 aa13.5□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 A0A0J9YX75 114 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 A8MTW9 85 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 IGLL1P15814 213 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 GNG4P50150 75 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 DEFB131AP59861 70 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM241Q24JQ0 296 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 ODF3L2Q3SX64 289 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM78Q5T7P6 136 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 OR11H12B2RN74 326 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 ATP6V1G1O75348 118 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF138P52744 262 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 CENPWQ5EE01 88 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 LINC00479Q96M42 142 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 BIN3Q9NQY0 253 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF492Q9P255 531 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 HLA-DRB4P13762 266 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 SAMD5Q5TGI4 173 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 BAGE2Q86Y30 109 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 VGLL1Q99990 258 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 NDFIP1Q9BT67 221 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 MLST8Q9BVC4 326 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 SDF2L1Q9HCN8 221 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 GTSCR1Q86UQ5 136 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 SVBPQ8N300 66 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 TVP23CQ96ET8 276 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 PRR25Q96S07 402 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 C19orf73Q9NVV2 129 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-210ENST00000559259 TGP01266 2768 aa13.46□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 CRISP2P16562 243 aa13.45□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 PRNTQ86SH4 94 aa13.45□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 LINC01551Q86U37 167 aa13.45□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 B4DEV8 164 aa13.44□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 H3BMM0 161 aa13.44□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 IGLV2-8P01709 118 aa13.44□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 APRG1Q8IVJ8 170 aa13.44□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 F6UB75 175 aa13.43□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 GCGP01275 180 aa13.43□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 CT45A10P0DMU9 189 aa13.43□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 RPL23P62829 140 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 ERCC8Q13216 396 aa13.43□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 OCC1Q8TAD7 63 aa13.43□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 SNAPINO95295 136 aa13.42□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 APOC3P02656 99 aa13.42□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 CD7P09564 240 aa13.42□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 TSPOP30536 169 aa13.42□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 OXLD1Q5BKU9 147 aa13.42□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 GDF5OSQ5U4N7 250 aa13.42□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 SGK494Q96LW2 274 aa13.42□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 LEPP41159 167 aa13.41□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 SMUG1Q53HV7 270 aa13.41□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 ACTL10Q5JWF8 245 aa13.41□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 AMTNQ6UX39 209 aa13.41□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 Q8TAT8 98 aa13.41□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 AMBPP02760 352 aa13.4□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 DEFB1P60022 68 aa13.4□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 RHEBQ15382 184 aa13.4□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.4□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 ISOC2Q96AB3 205 aa13.4□□□□□ -0.26
MFGE8-210ENST00000559259 KNCNA6PVL3 124 aa13.39□□□□□ -0.27
MFGE8-210ENST00000559259 KLLNB2CW77 178 aa13.39□□□□□ -0.27
MFGE8-210ENST00000559259 K7EN84 100 aa13.39□□□□□ -0.27
MFGE8-210ENST00000559259 ADIRFQ15847 76 aa13.39□□□□□ -0.27
MFGE8-210ENST00000559259 STHQ8IWL8 128 aa13.39□□□□□ -0.27
MFGE8-210ENST00000559259 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.39□□□□□ -0.27
MFGE8-210ENST00000559259 CLRN3Q8NCR9 226 aa13.39□□□□□ -0.27
MFGE8-210ENST00000559259 PGPEP1LA6NFU8 196 aa13.38□□□□□ -0.27
MFGE8-210ENST00000559259 CDKN1BP46527 198 aa13.38□□□□□ -0.27
MFGE8-210ENST00000559259 Q8N1Y9 231 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms