RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 C20orf173Q96LM9 149 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 A8MZ25 164 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 H3BMM0 161 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 LEPP41159 167 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 ZNF492Q9P255 531 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 PSG8Q9UQ74 426 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 A8MTW9 85 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 ZNF727A8MUV8 499 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 LTAP01374 205 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 CD7P09564 240 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 CT45A10P0DMU9 189 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 HLA-DMBP28068 263 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 GNG4P50150 75 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 GNG5P63218 68 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 LCE2CQ5TA81 110 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 TUBA4BQ9H853 241 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 TMEM218A2RU14 115 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 PRAC2D3DTV9 90 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 G3V4G9 280 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 UBE2CO00762 179 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SFTA3P0C7M3 94 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 CRISP2P16562 243 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 APOC4P55056 127 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 BAGE2Q86Y30 109 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 Q8N1Y9 231 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 PRR25Q96S07 402 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 ASCL2Q99929 193 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 VGLL1Q99990 258 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 SEC11CQ9BY50 192 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 PARLQ9H300 379 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-220ENST00000550700 NAT8Q9UHE5 227 aa6.9□□□□□ -1.3
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CS-220ENST00000550700 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 IGLV2-11P01706 119 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 GPX1P07203 203 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 CDKN1BP46527 198 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 CEBPGP53567 150 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 SMUG1Q53HV7 270 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 PRNTQ86SH4 94 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 Q86TA4 180 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 KNCNA6PVL3 124 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 F6UB75 175 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 F8W036 122 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 KRTAP10-11P60412 298 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 CENPWQ5EE01 88 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 DEFB125Q8N687 156 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 CITED4Q96RK1 184 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 CSTL1Q9H114 145 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 KLLNB2CW77 178 aa6.87□□□□□ -1.31
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CS-220ENST00000550700 C9JQL5 133 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 INSP01308 110 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 ERCC8Q13216 396 aa6.87□□□□□ -1.31
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CS-220ENST00000550700 LCE3BQ5TA77 95 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-220ENST00000550700 AMTNQ6UX39 209 aa6.87□□□□□ -1.31
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