RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548896.1

HECTD4-208, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 4

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-208ENST00000548896 BUB3O43684 328 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 OR5G3P0C626 314 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 RAB5AP20339 215 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 VDAC1P21796 283 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 GALR1P47211 349 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 CX3CL1P78423 397 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 LAGE3Q14657 143 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 NPBQ8NG41 125 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 LINC00477Q96M19 166 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 RBKSQ9H477 322 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 BET1LQ9NYM9 111 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 NAT8Q9UHE5 227 aa6.52□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 GAGE12JA6NER3 117 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 GAGE7O76087 117 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 KBTBD11O94819 623 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 KRASP01116 189 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 GAGE12FP0CL80 117 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 GAGE12GP0CL81 117 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 GAGE12IP0CL82 117 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 S100A10P60903 97 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 GAGE4Q13068 117 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 LY6EQ16553 131 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 RNF126Q9BV68 326 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 NRN1Q9NPD7 142 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.51□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 A6NDX4 124 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 YIF1AO95070 293 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 NDUFA3O95167 84 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 IGHV4-59P01825 116 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 IGKV1-16P04430 117 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 SLC25A6P12236 298 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 MYOD1P15172 320 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 SRIP30626 198 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 GPR183P32249 361 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 G6PCP35575 357 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 GNG4P50150 75 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 TMEM187Q14656 261 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 SP6Q3SY56 376 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 ACY3Q96HD9 319 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 PARP11Q9NR21 331 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.5□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 K7EPK0 472 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 PHOX2AO14813 284 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 HLA-DRB1P01911 266 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 GNB1P62873 340 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 PEA15Q15121 130 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 TMEM219Q86XT9 240 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 SLC35G3Q8N808 338 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 TMEM230Q96A57 120 aa6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 SMKR1H3BMG3 65 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 CD24P25063 80 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 CLINT1Q14677 625 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 TIGITQ495A1 244 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 ZNF429Q86V71 674 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 Q8N6K4 173 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 Q8N9W7 124 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 ARPC1AQ92747 370 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 TMEM101Q96IK0 257 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 SLC35E1Q96K37 410 aa6.48□□□□□ -1.37
HECTD4-208ENST00000548896 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.4 ms