RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	PDE6D	O43924	150 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	PAGE4	O60829	102 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	TCRA	P04437	139 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	CDKN1B	P46527	198 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF138	P52744	262 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF124	Q15973	351 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	HAGH	Q16775	308 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	VAX2	Q9UIW0	290 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1B0GV50	99 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	GGTLC3	B5MD39	225 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	C11orf94	C9JXX5	98 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730		F6UB75	175 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	RCHY1	Q96PM5	261 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	AGRN	O00468	2067 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	PEX7	O00628	323 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	INS	P01308	110 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	BCL2	P10415	239 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	UBE2G1	P62253	170 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF492	Q9P255	531 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	PRAC2	D3DTV9	90 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	SPRY2	O43597	315 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	CRISP2	P16562	243 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	AKR1C3	P42330	323 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	AMTN	Q6UX39	209 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	GPX1	P07203	203 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	RNF183	Q96D59	192 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	XCL2	Q9UBD3	114 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	CT45A10	P0DMU9	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	DEFB1	P60022	68 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	CCL20	P78556	96 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	VGLL1	Q99990	258 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	PSG8	Q9UQ74	426 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM250	H0YL14	139 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	ATP5G3	P48201	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	TAS2R60	P59551	318 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	GNG5	P63218	68 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	ERCC8	Q13216	396 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	PEA15	Q15121	130 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	C11orf52	Q96A22	123 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	TREM1	Q9NP99	234 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	C7orf71	A4D174	169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	KLLN	B2CW77	178 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730		H7BYZ3	331 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730		M0R2Z0	102 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	MIF	P14174	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	DEFB135	Q30KP9	77 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	SMUG1	Q53HV7	270 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	CLLU1	Q5K131	121 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	SMIM12	Q96EX1	92 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	FAM210A	Q96ND0	272 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	NEU1	Q99519	415 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	ASCL2	Q99929	193 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	RARRES2	Q99969	163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-224	ENST00000534730	BIN3	Q9NQY0	253 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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