RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 MBP02144 154 aa8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 Q6ZTC4 211 aa8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 Q9H3A6 140 aa8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 G3V3Q6 166 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 PRM2P04554 102 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 CT45A10P0DMU9 189 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 HTN3P15516 51 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 SERF2P84101 59 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 KIR3DS1Q14943 382 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF503Q96F45 646 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 IGLL5B9A064 214 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 C11orf94C9JXX5 98 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 TAAR5O14804 337 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 RGS13O14921 159 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 PFDN1O60925 122 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 GPX1P07203 203 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 Q8TAT8 98 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB24Q969Q5 203 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 VGLL1Q99990 258 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 OTORQ9NRC9 128 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 H7BYZ3 331 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 LY6G6CO95867 125 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 TAS2R60P59551 318 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 DAD1P61803 113 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 C12orf74Q32Q52 190 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00477Q96M19 166 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 ODF3Q96PU9 254 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 C7orf71A4D174 169 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 PGPA6NDG6 321 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 CXorf1O96002 111 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 DEFB130BP0DP73 79 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 DEFB130AP0DP74 79 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 AZU1P20160 251 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 GCHFRP30047 84 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 BTN1A1Q13410 526 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 C16orf74Q96GX8 76 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 DKK2Q9UBU2 259 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0D9SG52 128 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 DIRC3C9JPN6 131 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 STAG3L2P0CL84 134 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 STAG3L3P0CL85 134 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF138P52744 262 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 GNG5P63218 68 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 CD300CQ08708 224 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF345Q14585 488 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 CBY3A6NI87 242 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 HMSDA8MTL9 139 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 SNURFLB1AK76 121 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 BCL2L11O43521 198 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 UBE2G2P60604 165 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 SSX7Q7RTT5 188 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF492Q9P255 531 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.18□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 RBAKDNA6NC62 111 aa8.18□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.18□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 LYRM9A8MSI8 78 aa8.18□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 K7EQM0 130 aa8.18□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.18□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.18□□□□□ -1.1
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.4 ms