RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 AGPAT2O15120 278 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-210ENST00000527027 COX7A2P2O60397 106 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-210ENST00000527027 TSC22D2O75157 780 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-210ENST00000527027 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-210ENST00000527027 IGLC2P0DOY2 106 aa11.03□□□□□ -0.64
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PTPRU-210ENST00000527027 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.03□□□□□ -0.64
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PTPRU-210ENST00000527027 ERVFC1-1P60608 527 aa11.02□□□□□ -0.65
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PTPRU-210ENST00000527027 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRU-210ENST00000527027 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.01□□□□□ -0.65
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PTPRU-210ENST00000527027 C11orf1Q9H5F2 150 aa10.96□□□□□ -0.65
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PTPRU-210ENST00000527027 M0R3E3 92 aa10.95□□□□□ -0.66
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PTPRU-210ENST00000527027 BTN1A1Q13410 526 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRU-210ENST00000527027 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
PTPRU-210ENST00000527027 ATP6V1FQ16864 119 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRU-210ENST00000527027 MIC13Q5XKP0 118 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM252Q8N6L7 170 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRU-210ENST00000527027 PFDN5Q99471 154 aa10.95□□□□□ -0.66
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PTPRU-210ENST00000527027 OR5AC2Q9NZP5 309 aa10.95□□□□□ -0.66
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