RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 LEAP2Q969E1 77 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF134P52741 427 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 LHBP01229 141 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 IL4P05112 153 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 CD40P25942 277 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 POLEQ07864 2286 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 A0A0G2JNJ9 132 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 A8MWV9 139 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV1-46P01743 117 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 LOXL3P58215 753 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 MORN5Q5VZ52 161 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 CALYQ9NYX4 217 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 Q9UFV3 132 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 U3KQK5 164 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 PSMB2P49721 201 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1B0GUT8 65 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1B0GX51 115 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 CCL8P80075 99 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 FOXC1Q12948 553 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 HIST1H4GQ99525 98 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 RNF7Q9UBF6 113 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 IGKCP01834 107 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 GATA4P43694 442 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 BAALCQ8WXS3 180 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 IGF2RP11717 2491 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 NBASA2RRP1 2371 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 J3KT08 172 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 GNG5P63218 68 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 Q8NA96 180 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 CCL13Q99616 98 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 EPDR1Q9UM22 224 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 GFRALQ6UXV0 394 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ODF3Q96PU9 254 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 TNCP24821 2201 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ZZEF1O43149 2961 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 C9JAW5 83 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 FXYD7P58549 80 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 S1PR3Q99500 378 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 PYYP10082 97 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 BSPH1Q075Z2 132 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 RIGQ13278 110 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 C3orf56Q8N813 242 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM101Q96IK0 257 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 GAFA1Q96PS6 74 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 D6R8Y8 96 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TCL1BO95988 128 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 CGB3P0DN86 165 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 CGB7P0DN87 165 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 UBE2D1P51668 147 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ERVK-16P61578 105 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 PDPNQ86YL7 162 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 FXYD5Q96DB9 178 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 FMC1Q96HJ9 113 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TRGV9Q99603 122 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 RAXQ9Y2V3 346 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 M0R2P5 195 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 NPFFO15130 113 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 NUP37Q8NFH4 326 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 SGK494Q96LW2 274 aa6.64□□□□□ -1.35
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