RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMED1Q13445 227 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAPRE2Q15555 327 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEPPQ6URK8 271 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM159AQ6UWV7 190 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100A7AQ86SG5 101 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00269Q8N2A0 174 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 NKAIN3Q8N8D7 197 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10G2Q8NGC3 310 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4D5Q8NGN0 318 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2G3Q8NGZ4 309 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 SECTM1Q8WVN6 248 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 BORCS5Q969J3 196 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TVP23CQ96ET8 276 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 C4orf36Q96KX1 117 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ODF3Q96PU9 254 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHCHD5Q9BSY4 110 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM147Q9BVK8 224 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 SRRQ9GZT4 340 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRR13Q9NZ81 148 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1W2PNN7 141 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 BBIP1A8MTZ0 92 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 CFDP00746 253 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 HLA-DQB1P01920 261 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 SHBGP04278 402 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDK1P06493 297 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM236CP0DP71 79 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100GP29377 79 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 HTR2BP41595 481 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL5P46777 297 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 INPP1P49441 399 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 SULT1A2P50226 295 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 REG3AQ06141 175 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM16LQ309B1 348 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM229BQ4G0N7 80 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 MPV17L2Q567V2 206 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM268Q5VZI3 342 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM236Q5W0B7 351 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 LAIR2Q6ISS4 152 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRSS54Q6PEW0 395 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 EPGNQ6UW88 154 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 DHRSXQ8N5I4 330 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 DTD1Q8TEA8 209 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAFIPQ8WZ33 124 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ISOC2Q96AB3 205 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYYR1Q96J86 154 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCL28Q9NRJ3 127 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAGKQ9UJ70 344 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF24Q9Y225 148 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9orf92A6NGG3 77 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR31O00270 319 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC17A3O00476 420 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNGT2O14610 69 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGS10O43665 173 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRKYO43930 277 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 NUPR1O60356 82 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF253O75346 499 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPINK1P00995 79 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 GHRHP01286 108 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RLN1P04808 185 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4E1P0C645 316 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAP2AP10114 183 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 DTYMKP23919 212 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 GADD45AP24522 165 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RANBP1P43487 201 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 LPAR6P43657 344 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAP2BP61225 183 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF266Q14584 549 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 C6orf99Q4VX62 202 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSD17B12Q53GQ0 312 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 COQ5Q5HYK3 327 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 GGNBP1Q5YKI7 109 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 LCN15Q6UWW0 184 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q6ZVH6 145 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms