RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 BLNKQ8WV28 456 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 ABCA13Q86UQ4 5058 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 KLLNB2CW77 178 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 BTN1A1Q13410 526 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 ATP6V1FQ16864 119 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 LINC00477Q96M19 166 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 PRELID1Q9Y255 219 aa11.68□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 A0A096LPF7 62 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PPQ1 181 aa11.67□□□□□ -0.54
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HERC3-211ENST00000513325 PDE6HQ13956 83 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 C18orf15Q96N68 181 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 GPX1P07203 203 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 FUT9Q9Y231 359 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 KLF12Q9Y4X4 402 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 MPDU1O75352 247 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 CRISP2P16562 243 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP10-2P60368 255 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 ICAM4Q14773 271 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 SPINK4O60575 86 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 TCL1AP56279 114 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 NHLH2Q02577 135 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 PRR9Q5T870 116 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 THAP6Q8TBB0 222 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 VGLL1Q99990 258 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 CCDC32Q9BV29 185 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa11.64□□□□□ -0.55
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HERC3-211ENST00000513325 RGS13O14921 159 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3-53P01767 116 aa11.62□□□□□ -0.55
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HERC3-211ENST00000513325 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 ZNF492Q9P255 531 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 PAX4O43316 350 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 LINC00315P59091 139 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 Q8N1X5 172 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 ST6GAL2Q96JF0 529 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 OR51M1Q9H341 326 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 NDUFA13Q9P0J0 144 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 SIVA1O15304 175 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 SIX6O95475 246 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 OR10J4P0C629 311 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.6□□□□□ -0.55
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HERC3-211ENST00000513325 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.6□□□□□ -0.55
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HERC3-211ENST00000513325 E5RGE8 158 aa11.59□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 NXPH4O95158 308 aa11.59□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 ZNF138P52744 262 aa11.59□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa11.59□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 Q8TAT8 98 aa11.59□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 PAXXQ9BUH6 204 aa11.59□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 SCRT2Q9NQ03 307 aa11.59□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 PRO0255Q9UI72 69 aa11.59□□□□□ -0.55
HERC3-211ENST00000513325 ASAH1Q13510 395 aa11.58□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.58□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 C8orf49Q96NF6 230 aa11.58□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.58□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 DNAH5Q8TE73 4624 aa11.57□□□□□ -0.56
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