RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495702.5

CEP41-215, Transcript of centrosomal protein 41, human

TSL 1 (best)

Gene CEP41, Length 733 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP41-215	ENST00000495702	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	CTDSPL	O15194	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	PRAF2	O60831	178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	HOXB5	P09067	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	SLC25A6	P12236	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	LEP	P41159	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	SELENOT	P62341	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	CTF1	Q16619	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	GOSR2	O14653	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	CXCL2	P19875	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	EVI2A	P22794	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	S100A5	P33763	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	AP3S2	P59780	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	SLA	Q13239	276 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CEP41-215	ENST00000495702	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	C7orf71	A4D174	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702		E5RGE8	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702		K7EP13	123 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	SLC17A3	O00476	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	PSCA	O43653	123 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	SPINK4	O60575	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	CRYBA4	P53673	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	VAMP2	P63027	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702		H3BQ15	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	AGPAT2	O15120	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	MPDU1	O75352	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	CCNK	O75909	580 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	SFT2D2	O95562	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	GPX1	P07203	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	CRYGD	P07320	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	SRI	P30626	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	TCL1A	P56279	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	CD300C	Q08708	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	ERCC8	Q13216	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	SMIM8	Q96KF7	97 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702		H3BMQ9	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702		K7EPK0	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CEP41-215	ENST00000495702		K7EQD1	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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