RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 BMI1P35226 326 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 GNG4P50150 75 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ADIRFQ15847 76 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 PRNTQ86SH4 94 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.02□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 A0A087WWC5 75 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 M0QZ24 198 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 CT45A10P0DMU9 189 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 CSN1S1P47710 185 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 TFPI2P48307 235 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 RHEBQ15382 184 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 Q8TAT8 98 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 C8orf49Q96NF6 230 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 PRR25Q96S07 402 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 MDFIQ99750 246 aa7.01□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 C19orf71A6NCJ1 209 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 B4DEV8 164 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 NPIPB6E9PJ23 425 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF688P0C7X2 276 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 UBE2G1P62253 170 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 BTN1A1Q13410 526 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 OR8A1Q8NGG7 326 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 SMIM12Q96EX1 92 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 SFRP2Q96HF1 295 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM242Q9NWH2 141 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF492Q9P255 531 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 V9GYV3 84 aa7□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ID1P41134 155 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF124Q15973 351 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 PRR9Q5T870 116 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 Q6ZQT7 251 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF738Q8NE65 137 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 NUDT11Q96G61 164 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 TUBA4BQ9H853 241 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 OSTCQ9NRP0 149 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 JMJD1CQ15652 2540 aa6.99□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 A0A0J9YX75 114 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 COLCA2A8K830 154 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 A8MTW9 85 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 SAP30O75446 220 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 PF4P02776 101 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 CD33P20138 364 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF138P52744 262 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 DEFB131AP59861 70 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 KIR3DS1Q14943 382 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 PSMG4Q5JS54 123 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 LINC00477Q96M19 166 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.98□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 KNCNA6PVL3 124 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 K7EQM0 130 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 ERVFC1-1P60608 527 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 PAFAH1B2P68402 229 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 AMTNQ6UX39 209 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.97□□□□□ -1.29
SEC22C-216ENST00000493107 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.96□□□□□ -1.3
SEC22C-216ENST00000493107 CXorf65A6NEN9 183 aa6.96□□□□□ -1.3
SEC22C-216ENST00000493107 MT-ND4LP03901 98 aa6.96□□□□□ -1.3
SEC22C-216ENST00000493107 CXCL1P09341 107 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.1 ms