RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		7.77	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		7.77	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		7.77	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		7.76	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		7.76	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	GAS8-AS1	O95177	125 aa		7.76	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	CEACAM3	P40198	252 aa		7.76	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		7.76	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP6V0B	Q99437	205 aa		7.76	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		7.76	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	RAX	Q9Y2V3	346 aa		7.76	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	IGKV1-17	P01599	117 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	CRIP1	P50238	77 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	ADAMTS20	P59510	1910 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	SYT8	Q8NBV8	401 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	PRO3102	Q9H379	93 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	TECTA	O75443	2155 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	SPINK8	P0C7L1	97 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	KLRD1	Q13241	179 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	NACA	E9PAV3	2078 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM178B	H3BS89	294 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	TNFRSF14	Q92956	283 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP5L	O75964	103 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	CD59	P13987	128 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	MYCNOS	P40205	109 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	PRSS33	Q8NF86	280 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF815P	A8K554	130 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV2-23	P01705	113 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	ADIPOQ	Q15848	244 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	C12orf74	Q32Q52	190 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	CEND1	Q8N111	149 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	ATRX	P46100	2492 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLL5	B9A064	214 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	INSL3	P51460	131 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	CR1L	Q2VPA4	569 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	GLMP	Q8WWB7	406 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHG3	P01860	377 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	PRTN3	P24158	256 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	PTH2	Q96A98	100 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	PRR25	Q96S07	402 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	DKK4	Q9UBT3	224 aa		7.74	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		7.73	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC01549	A6NIU2	74 aa		7.73	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		7.73	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		7.73	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	C20orf78	Q9BR46	151 aa		7.73	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		7.73	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		7.73	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		7.73	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	FGF6	P10767	208 aa		7.73	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		7.73	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	DLX6	P56179	175 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	DTX2	Q86UW9	622 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	MGA	Q8IWI9	3026 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV2-11	P01706	119 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	HLA-DRB4	P13762	266 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	NDP	Q00604	133 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	LAGE3	Q14657	143 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC01560	Q8TB33	94 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	C16orf92	Q96LL3	132 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		7.72	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A096LNJ9	63 aa		7.71	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		7.71	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	NBR2	O15453	112 aa		7.71	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	GATA4	P43694	442 aa		7.71	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		7.71	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		7.71	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		7.71	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		7.71	□□□□□ -1.17
ERCC3-208	ENST00000491292		H3BRN7	92 aa		7.71	□□□□□ -1.18
ERCC3-208	ENST00000491292	PRSS2	P07478	247 aa		7.71	□□□□□ -1.18

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