RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490667.1

SHC1-211, Transcript of SHC adaptor protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SHC1, Length 727 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1-211ENST00000490667 C7orf71A4D174 169 aa9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 GIPP09681 153 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 M6PRP20645 277 aa9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 CSN1S1P47710 185 aa9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 RGS21Q2M5E4 152 aa9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 KHDC3LQ587J8 217 aa9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 ASB13Q8WXK3 278 aa9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 AQP10Q96PS8 301 aa9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 VGLL1Q99990 258 aa9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.3□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 A0A1W2PPV4 95 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 KLLNB2CW77 178 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 F5H768 121 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 ATP5G1P05496 136 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 GPX1P07203 203 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 NMBP08949 121 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 ATP5G3P48201 142 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 CD300CQ08708 224 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 ZNF266Q14584 549 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 Q9H3A6 140 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 ZNF492Q9P255 531 aa9.29□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 SNURFLB1AK76 121 aa9.28□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 CRISP2P16562 243 aa9.28□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 ZNF138P52744 262 aa9.28□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 RAB2AP61019 212 aa9.28□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 BTN1A1Q13410 526 aa9.28□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.28□□□□□ -0.92
SHC1-211ENST00000490667 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 PGPA6NDG6 321 aa9.27□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.27□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.27□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.27□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.27□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 GAGE12BA1L429 117 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 RBAKDNA6NC62 111 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 GAGE7O76087 117 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 GAGE12FP0CL80 117 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 GAGE12GP0CL81 117 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 GAGE12IP0CL82 117 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 ATP6V0CP27449 155 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 HYLS1Q96M11 299 aa9.26□□□□□ -0.93
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SHC1-211ENST00000490667 OTORQ9NRC9 128 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.26□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 DIRC3C9JPN6 131 aa9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 MBP02144 154 aa9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 SERF2P84101 59 aa9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 RNF212Q495C1 297 aa9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 PRR9Q5T870 116 aa9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 Q8TAT8 98 aa9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.25□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 KMT2AQ03164 3969 aa9.24□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 RNF222A6NCQ9 220 aa9.24□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 RGS13O14921 159 aa9.24□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 OR5I1Q13606 314 aa9.24□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 Q6ZQT7 251 aa9.24□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.24□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.24□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 RAB24Q969Q5 203 aa9.24□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.23□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.23□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 M0R2N4 97 aa9.23□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 NUDT3O95989 172 aa9.23□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 STAG3L2P0CL84 134 aa9.23□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 STAG3L3P0CL85 134 aa9.23□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 Q6ZTI0 123 aa9.23□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.23□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.23□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.23□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.23□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.22□□□□□ -0.93
SHC1-211ENST00000490667 TMED6Q8WW62 240 aa9.22□□□□□ -0.93
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