RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490432.1

TAF1B-208, Transcript of TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene TAF1B, Length 620 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1B-208ENST00000490432 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 OR7C2O60412 319 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 LEPP41159 167 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 ZNF266Q14584 549 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 SUN5Q8TC36 379 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 FAM210BQ96KR6 192 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 LINC00477Q96M19 166 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 LINC01587Q99440 93 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 VGLL1Q99990 258 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 Q9H3A6 140 aa8.75□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 RBAKDNA6NC62 111 aa8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 NMBP08949 121 aa8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 ATP6V0CP27449 155 aa8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 TAS2R45P59539 299 aa8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 CD300CQ08708 224 aa8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 ZNF492Q9P255 531 aa8.74□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 NACAE9PAV3 2078 aa8.73□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 C7orf71A4D174 169 aa8.73□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 STAG3L2P0CL84 134 aa8.73□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 STAG3L3P0CL85 134 aa8.73□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 DAD1P61803 113 aa8.73□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 BTN1A1Q13410 526 aa8.73□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.73□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.73□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.73□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.73□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 DIRC3C9JPN6 131 aa8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 Q6ZQT7 251 aa8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 SSX7Q7RTT5 188 aa8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 Q8TAT8 98 aa8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TAF1B-208ENST00000490432 J3KRW8 73 aa8.71□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.71□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 RANP62826 216 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 SERF2P84101 59 aa8.71□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.71□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.71□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 OTORQ9NRC9 128 aa8.71□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.71□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.7□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 CBY3A6NI87 242 aa8.7□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 ZNF138P52744 262 aa8.7□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 ZNF726P1Q15940 193 aa8.7□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 TMED6Q8WW62 240 aa8.7□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 RAB24Q969Q5 203 aa8.7□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 C18orf15Q96N68 181 aa8.7□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.7□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 DEFB130BP0DP73 79 aa8.69□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 DEFB130AP0DP74 79 aa8.69□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 HTN1P15515 57 aa8.69□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.69□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 Q6AWC8 147 aa8.69□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.69□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 TVP23CQ96ET8 276 aa8.69□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 A0A1W2PPV4 95 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 PGPA6NDG6 321 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 SMLR1H3BR10 107 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 ATP5G1P05496 136 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 P0DMU3 169 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 FAM231AP0DMU4 169 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 FAM231CP0DMU5 169 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 HTN3P15516 51 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 GCHFRP30047 84 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 ATP5G3P48201 142 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.68□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 GGTLC3B5MD39 225 aa8.67□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 SPINK4O60575 86 aa8.67□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 MBP02144 154 aa8.67□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 GPX1P07203 203 aa8.67□□□□□ -1.02
TAF1B-208ENST00000490432 HOXA5P20719 270 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms