RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 FXYD7P58549 80 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 PRELID3AQ96N28 172 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 JMJD1CQ15652 2540 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 IQCJQ1A5X6 159 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 ORMDL3Q8N138 153 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 RCHY1Q96PM5 261 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 PAX2Q02962 417 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 PATE2Q6UY27 113 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 C2orf70A6NJV1 201 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 CDKN1BP46527 198 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 APOC4P55056 127 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 NUDT3O95989 172 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 PPBPP02775 128 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 HTN3P15516 51 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf52Q96A22 123 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 PRR25Q96S07 402 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 XCL2Q9UBD3 114 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 GP9P14770 177 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC140Q96MF4 163 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF492Q9P255 531 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 ADMP35318 185 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 NIT2Q9NQR4 276 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 CD28P10747 220 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 C7orf71A4D174 169 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 C17orf77Q96MU5 243 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 GZMBP10144 247 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 INSL3P51460 131 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF702PQ9H963 129 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 RBAKDNA6NC62 111 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 KNCNA6PVL3 124 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 TRBV12-3P01733 135 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 HERVK_113P61574 105 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 VAMP8Q9BV40 100 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 RASL11AQ6T310 242 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM160Q9NX00 188 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 LEPROTL1O95214 131 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 CT83Q5H943 113 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 SMR3AQ99954 134 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 FAM231BA6NCW3 169 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 C9JQL5 133 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 LINC01006Q8NI28 216 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS46E5RG02 174 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 PLXNB1O43157 2135 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 BATFQ16520 125 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 MORN5Q5VZ52 161 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 VGLL1Q99990 258 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 ST20Q9HBF5 79 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 LGALS9O00182 355 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 CRLF1O75462 422 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 PSMB8P28062 276 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 C8orf49Q96NF6 230 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 PHOX2AO14813 284 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 HLA-DMBP28068 263 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-211ENST00000486161 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.37□□□□□ -1.39
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