RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484075.5

CRB1-208, Transcript of crumbs 1, cell polarity complex component, human

TSL 1 (best)

Gene CRB1, Length 5,174 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRB1-208	ENST00000484075	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	ZNF292	O60281	2723 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	SLURP1	P55000	103 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	DAD1	P61803	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	SLA	Q13239	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075		A0A087WWL8	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	MAL	P21145	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	GAGE7	O76087	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	LHB	P01229	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	NCR2	O95944	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	TOMM40	O96008	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	TYMS	P04818	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075		F6UB75	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	IGLV3-1	P01715	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075		A0A1B0GUS0	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	TSPAN13	O95857	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	IFITM2	Q01629	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075		Q6AWC8	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075		A0A096LPF7	62 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075		Q8N7P7	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	NDUFA4	O00483	81 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	PAX9	P55771	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	ODF1	Q14990	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	TCF23	Q7RTU1	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	HTT	P42858	3142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	GP9	P14770	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	PLP1	P60201	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	FOXC2	Q99958	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	TRIAP1	O43715	76 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	SNAI2	O43623	268 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CRB1-208	ENST00000484075		Q8N9W7	124 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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