RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 A0A096LNJ9 63 aa12.82□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CNIH1O95406 144 aa12.82□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GATA4P43694 442 aa12.82□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 NPIPB5A8MRT5 1133 aa12.82□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 IGFL4Q6B9Z1 124 aa12.82□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 OTORQ9NRC9 128 aa12.82□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CR1LQ2VPA4 569 aa12.82□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TTC9CQ8N5M4 171 aa12.82□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 Q8TAT8 98 aa12.82□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM133Q9H2Q1 129 aa12.82□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 COX7A1P24310 79 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CYSLTR1Q9Y271 337 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 IGLL5B9A064 214 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 IGKCP01834 107 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PSMB2P49721 201 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MAP1LC3AQ9H492 121 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MSRB1Q9NZV6 116 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 FAM104BQ5XKR9 115 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 Q8NA96 180 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MRAP2Q96G30 205 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SCNM1Q9BWG6 230 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CTSZQ9UBR2 303 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM8BA6NDV4 472 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 F8W1H4 67 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MYCNOSP40205 109 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 FOXI2Q6ZQN5 318 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM75Q8N9X5 138 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00312Q9Y6C7 94 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GRNP28799 593 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ARL3P36405 182 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf46Q8TAG6 207 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GLMPQ8WWB7 406 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 AAMDCQ9H7C9 122 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 UFC1Q9Y3C8 167 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GP9P14770 177 aa12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 POU2AF1Q16633 256 aa12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CEND1Q8N111 149 aa12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PTH2Q96A98 100 aa12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM178BH3BS89 294 aa12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CNTFRP26992 372 aa12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SCGB1D4Q6XE38 83 aa12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SIVA1O15304 175 aa12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 IL4P05112 153 aa12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 C12orf74Q32Q52 190 aa12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ASCL5Q7RTU5 278 aa12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM158Q8WZ71 300 aa12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SCGB1A1P11684 91 aa12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RPEQ96AT9 228 aa12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 E7EQL1 145 aa12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GAS8-AS1O95177 125 aa12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 DPM2O94777 84 aa12.77□□□□□ -0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CGB1A6NKQ9 187 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MT-ATP8P03928 68 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SCGB1C2P0DMR2 95 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ANAPC13Q9BS18 74 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 NGBQ9NPG2 151 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MYOZ3Q8TDC0 251 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 VSTM5A8MXK1 200 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SH2D1AO60880 128 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CRIP1P50238 77 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TEX36Q5VZQ5 186 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 NUP37Q8NFH4 326 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 GATA3P23771 443 aa12.75□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa12.75□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 FBXL15Q9H469 300 aa12.75□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 IGF2-ASQ6U949 168 aa12.75□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.75□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 DPF1Q92782 380 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 RNF183Q96D59 192 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SPG11Q96JI7 2443 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 B5MCH6 92 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 J3KRW8 73 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-23P01764 117 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 LOXP28300 417 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TRGV9Q99603 122 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 H7C2G1 150 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 FSTL3O95633 263 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf86Q6ZUL3 223 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 THAP8Q8NA92 274 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV2-11P01706 119 aa12.73□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF562Q6V9R5 426 aa12.73□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa12.73□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF502Q8TBZ5 544 aa12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 165.4 ms