RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 SPINK4O60575 86 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF253O75346 499 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 BTCP35070 178 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 INPP1P49441 399 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 BTN1A1Q13410 526 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB31Q13636 194 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 BAK1Q16611 211 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 MITD1Q8WV92 249 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 L7N2F9 121 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 CCSO14618 274 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 CST7O76096 145 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFB4O95168 129 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-53P01767 116 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 TCL1AP56279 114 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 VAMP2P63027 116 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZRG5 221 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.4□□□□□ -1.38
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SMARCE1-210ENST00000481231 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A087WTM6 91 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC160A6NGH7 325 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 MPDU1O75352 247 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 CRISP2P16562 243 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 GCSHP23434 173 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 BCAP31P51572 246 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 CAV2P51636 162 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 VWC2Q2TAL6 325 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR9Q5T870 116 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZQT7 251 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00477Q96M19 166 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 C8orf49Q96NF6 230 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 PFDN5Q99471 154 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM25EA8MYX2 175 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 PYYP10082 97 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 CRYBA4P53673 196 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 PDE6HQ13956 83 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 FHL2Q14192 279 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF846Q147U1 533 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 NFE4Q86UQ8 179 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 VGLL1Q99990 258 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 PRO0255Q9UI72 69 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 PRELID1Q9Y255 219 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 LRP2P98164 4655 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 IGSF23A1L1A6 192 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 CENPXA8MT69 81 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 RGS13O14921 159 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 PRAF2O60831 178 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 GPX1P07203 203 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 NMBP08949 121 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 BAXQ07812 192 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 SLAQ13239 276 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 BLNKQ8WV28 456 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 E5RGE8 158 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-210ENST00000481231 IL7P13232 177 aa6.36□□□□□ -1.39
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