RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480104.5

USP11-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 697 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-208ENST00000480104 CRISP2P16562 243 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 CACNG7P62955 275 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 MUC21Q5SSG8 566 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 Q8TAT8 98 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 COPZ2Q9P299 210 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.3□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.29□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.29□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 LINC00869P0C866 280 aa7.29□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.29□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.29□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 AKR1C1Q04828 323 aa7.29□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.29□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.28□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 IL5P05113 134 aa7.28□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.28□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.28□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.28□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.28□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.28□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 OR52I2Q8NH67 350 aa7.28□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.28□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 SCN3BQ9NY72 215 aa7.28□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.28□□□□□ -1.24
USP11-208ENST00000480104 M0R3E3 92 aa7.27□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 ZNF253O75346 499 aa7.27□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 PLP1P60201 277 aa7.27□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 Q0VG73 95 aa7.27□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 BAK1Q16611 211 aa7.27□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 PATE2Q6UY27 113 aa7.27□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.27□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 SRRQ9GZT4 340 aa7.27□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.27□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 S100A14Q9HCY8 104 aa7.27□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 PRSS46E5RG02 174 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 H3BQ15 152 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 M0R2P5 195 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 B3GALNT1O75752 331 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 NMBP08949 121 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 IGLC2P0DOY2 106 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 RAB11AP62491 216 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 RAB31Q13636 194 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 LHFPL1Q86WI0 220 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 C8orf4Q9NR00 106 aa7.26□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 A0A087WWC5 75 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 C5orf51A6NDU8 294 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 LINC00694P0DN24 101 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 IAPPP10997 89 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 PRSS3P35030 304 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 MXD1Q05195 221 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 S100A7AQ86SG5 101 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 ARL6Q9H0F7 186 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 ARV1Q9H2C2 271 aa7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 A0A087WX48 190 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 GAGE12JA6NER3 117 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 GAGE1Q13065 139 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 GAGE4Q13068 117 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 GAGE5Q13069 117 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 ELOBQ15370 118 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 MAJINQ3KP22 176 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 GAGE13Q4V321 117 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 C4orf46Q504U0 113 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 ENHOQ6UWT2 76 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 DUSP21Q9H596 190 aa7.24□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 TNFAIP8O95379 198 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 SDC2P34741 201 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 CCR6P51684 374 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 SMCO1Q147U7 214 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 Q6ZRP5 223 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 GPX8Q8TED1 209 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 RNF24Q9Y225 148 aa7.23□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 SMCO3A2RU48 225 aa7.22□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 PGPA6NDG6 321 aa7.22□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
USP11-208ENST00000480104 CRPP02741 224 aa7.22□□□□□ -1.25
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