RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 STOML3Q8TAV4 291 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 FXYD5Q96DB9 178 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 DKK2Q9UBU2 259 aa9.27□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 SLC17A3O00476 420 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 CXorf1O96002 111 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 AZU1P20160 251 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 ZFP69Q49AA0 526 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 BAP18Q8IXM2 172 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 BLNKQ8WV28 456 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 RAB24Q969Q5 203 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 PRAC2D3DTV9 90 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 NDUFB4O95168 129 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 HBE1P02100 147 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 OR10J4P0C629 311 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 CSN1S1P47710 185 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 KIR3DS1Q14943 382 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 ODF3Q96PU9 254 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.25□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 TMEM189A5PLL7 270 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 HTN3P15516 51 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 TSPOP30536 169 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 RAB5CP51148 216 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 RRN3P1Q2M238 152 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 SLC51BQ86UW2 128 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 SUN5Q8TC36 379 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 ZNF503Q96F45 646 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 OTORQ9NRC9 128 aa9.24□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.23□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.23□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 GCHFRP30047 84 aa9.23□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 ICAM4Q14773 271 aa9.23□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 LINC00477Q96M19 166 aa9.23□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.23□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 Q9H3A6 140 aa9.23□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 RBAKDNA6NC62 111 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 RANP62826 216 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.22□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HPS1-211ENST00000478087 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 A0A1B0GVG6 124 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 M0R2N4 97 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 INSP01308 110 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 HTN1P15515 57 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 LEPP41159 167 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 PKD1P98161 4303 aa9.21□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 A0A1W2PRE2 83 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 TEX46H3BTG2 121 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 M0R3E3 92 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 NMBP08949 121 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 CDKN1BP46527 198 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 PPT1P50897 306 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 DAD1P61803 113 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 TMED6Q8WW62 240 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 LINC01587Q99440 93 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.2□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 PGPA6NDG6 321 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 J3KRW8 73 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 K7EQM0 130 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 DEFB130BP0DP73 79 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 DEFB130AP0DP74 79 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 ZNF726P1Q15940 193 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 PKHD1P08F94 4074 aa9.19□□□□□ -0.94
HPS1-211ENST00000478087 DIRC3C9JPN6 131 aa9.18□□□□□ -0.94
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