RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 RANP62826 216 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 Q9H3A6 140 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 CRISP2P16562 243 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 DAD1P61803 113 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 FAM122CQ6P4D5 195 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 TMED6Q8WW62 240 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 ZNF503Q96F45 646 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 OTORQ9NRC9 128 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 KLLNB2CW77 178 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 ARPC5O15511 151 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 LY6G6CO95867 125 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 GPX1P07203 203 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 STAG3L2P0CL84 134 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 STAG3L3P0CL85 134 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 RAB2AP61019 212 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 ZNF345Q14585 488 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 ZNF492Q9P255 531 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-211ENST00000476336 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 C7orf71A4D174 169 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 HMSDA8MTL9 139 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 CXorf1O96002 111 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 HTN1P15515 57 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 ZNF138P52744 262 aa9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-211ENST00000476336 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 RAB24Q969Q5 203 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 A0A0D9SG52 128 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 PGPA6NDG6 321 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 DIRC3C9JPN6 131 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 K7EQM0 130 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 APLNQ9ULZ1 77 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-211ENST00000476336 G3V3Q6 166 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-211ENST00000476336 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-211ENST00000476336 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-211ENST00000476336 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 VGLL1Q99990 258 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 CBY3A6NI87 242 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 ATP5G1P05496 136 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 P0DMU3 169 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 FAM231AP0DMU4 169 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 FAM231CP0DMU5 169 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 GCHFRP30047 84 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 ATP5G3P48201 142 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 HYLS1Q96M11 299 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 J3KRW8 73 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 KIR3DS1Q14943 382 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 KMT2AQ03164 3969 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PRE2 83 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 UMAD1C9J7I0 102 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 RGS13O14921 159 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 DEFB130BP0DP73 79 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 DEFB130AP0DP74 79 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PRAME-211ENST00000476336 PRM2P04554 102 aa9.46□□□□□ -0.9
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