RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00527Q9UJ94 153 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 MTORP42345 2549 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 A8MWP6 167 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PAX4O43316 350 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 TGFAP01135 160 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 P01737 135 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 S100A7P31151 101 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ARL3P36405 182 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 RAB4BP61018 213 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35B1P78383 322 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 S100A12P80511 92 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 LCN12Q6JVE5 192 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 TCF24Q7RTU0 167 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PRNTQ86SH4 94 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 C8orf49Q96NF6 230 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 VGLL1Q99990 258 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SLC50A1Q9BRV3 221 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 CNFNQ9BYD5 112 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 GNB4Q9HAV0 340 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 VPREB3Q9UKI3 123 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 GRIFINA4D1Z8 144 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 K7EMT4 169 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SH2D1AO60880 128 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SERF1AO75920 110 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 IGLC6P0CF74 106 aa4.29□□□□□ -1.72
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PTPRC-210ENST00000462363 FABP4P15090 132 aa4.29□□□□□ -1.72
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PTPRC-210ENST00000462363 S100A2P29034 98 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 CTRLP40313 264 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 TPPP2P59282 170 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM95Q3KNT9 176 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 FAM209BQ5JX69 171 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PRR27Q6MZM9 219 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 Q8N976 141 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.29□□□□□ -1.72
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PTPRC-210ENST00000462363 Q96MF0 132 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 RCHY1Q96PM5 261 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 METTL26Q96S19 204 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ASCL2Q99929 193 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 RNF114Q9Y508 228 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.29□□□□□ -1.72
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PTPRC-210ENST00000462363 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0G2JLM5 398 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 K7EQM0 130 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SPINK4O60575 86 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 APCSP02743 223 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
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PTPRC-210ENST00000462363 FOXE3Q13461 319 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 Q6AWC8 147 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZWC4 215 aa4.28□□□□□ -1.72
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PTPRC-210ENST00000462363 RNF182Q8N6D2 247 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 OR4X2Q8NGF9 303 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 OR2D3Q8NGH3 330 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 Q8TAT8 98 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 NIT2Q9NQR4 276 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SERTAD4Q9NUC0 356 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GUT8 65 aa4.27□□□□□ -1.73
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