RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD300CQ08708 224 aa5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERCC8Q13216 396 aa5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 BTN1A1Q13410 526 aa5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5I1Q13606 314 aa5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 S100A7AQ86SG5 101 aa5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 C18orf15Q96N68 181 aa5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q9H3A6 140 aa5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.82□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAT1Q14517 4588 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 C7orf71A4D174 169 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNURFLB1AK76 121 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 L7N2F9 121 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRISP2P16562 243 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 SULT1A1P50225 295 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCAP31P51572 246 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 VAMP2P63027 116 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 BAXQ07812 192 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 GUK1Q16774 197 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZRG5 221 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 PFDN5Q99471 154 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00467Q9BRT7 94 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 C5orf51A6NDU8 294 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 H0YIZ8 118 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 RLN2P04090 185 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 LEPP41159 167 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 NHLH2Q02577 135 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLINT1Q14677 625 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF846Q147U1 533 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.8□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPINK4O60575 86 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGF7P21781 194 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 S100A11P31949 105 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCL1AP56279 114 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00315P59091 139 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 S100A10P60903 97 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDE6HQ13956 83 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 VGLL1Q99990 258 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC32Q9BV29 185 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.79□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PPQ1 181 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIX6O95475 246 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB31Q13636 194 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 ICAM4Q14773 271 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP6V1FQ16864 119 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTC32Q5I0X7 151 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q8N1X5 172 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 BLNKQ8WV28 456 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 FXYD5Q96DB9 178 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00477Q96M19 166 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF492Q9P255 531 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 FUT9Q9Y231 359 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRELID1Q9Y255 219 aa5.78□□□□□ -1.48
GAPDHP28-201ENST00000455134 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.77□□□□□ -1.49
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.77□□□□□ -1.49
GAPDHP28-201ENST00000455134 MPDU1O75352 247 aa5.77□□□□□ -1.49
GAPDHP28-201ENST00000455134 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.77□□□□□ -1.49
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
GAPDHP28-201ENST00000455134 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
GAPDHP28-201ENST00000455134 HBG1P69891 147 aa5.77□□□□□ -1.49
GAPDHP28-201ENST00000455134 HBG2P69892 147 aa5.77□□□□□ -1.49
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFITM3Q01628 133 aa5.77□□□□□ -1.49
GAPDHP28-201ENST00000455134 FHL2Q14192 279 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms