RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447271.1

PTPN3-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, human

TSL 2

Gene PTPN3, Length 587 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN3-205	ENST00000447271	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		V9GYV3	84 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	LTA	P01374	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	HLA-DRB1	P01911	266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	AMBP	P02760	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PPBP	P02775	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	IL4	P05112	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	DDT	P30046	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	METTL26	Q96S19	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ASCL2	Q99929	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		A0A1B0GUT8	65 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		M0R143	59 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SLC17A3	O00476	420 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	BRI3	O95415	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PPP1R17	O96001	155 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	GPX1	P07203	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	GZMB	P10144	247 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	MYCNOS	P40205	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	AMT	P48728	403 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	CTAG1A	P78358	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PSG3	Q16557	428 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271		A0A1W2PRD5	423 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271		A0A1W2PRF3	423 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271		A0A1W2PRM7	423 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271		K7EN84	100 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	OR2J3	O76001	311 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	CLEC3B	P05452	202 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	OR5I1	Q13606	314 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN3-205	ENST00000447271	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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